26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A2150 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  100 
 
 
195 aa  385  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  56.92 
 
 
195 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  56.32 
 
 
195 aa  186  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  50.79 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  41.12 
 
 
199 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  33.78 
 
 
202 aa  96.7  2e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  37.74 
 
 
203 aa  87  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  34.39 
 
 
205 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  34.98 
 
 
197 aa  81.3  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  33.69 
 
 
204 aa  79  0.00000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  37.09 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  36.73 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  32.64 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  31.38 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  31.54 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  62.8  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  32.67 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  37.5 
 
 
200 aa  61.2  0.000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  32 
 
 
193 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  30.13 
 
 
165 aa  57  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  31.02 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  48.1  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  25.67 
 
 
200 aa  47.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1856  hypothetical protein  26.34 
 
 
174 aa  45.8  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.986469  normal  0.0497867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0334  hypothetical protein  29.67 
 
 
203 aa  44.7  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.79896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>