24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5848 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  53.89 
 
 
195 aa  199  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  51.76 
 
 
195 aa  148  5e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  47.98 
 
 
195 aa  148  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  35.05 
 
 
199 aa  101  6e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  33.17 
 
 
202 aa  93.6  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  35.9 
 
 
203 aa  86.3  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  35.1 
 
 
194 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  32.28 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  31.79 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  35.57 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  32.64 
 
 
197 aa  58.5  0.00000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  28.38 
 
 
192 aa  54.7  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  30.99 
 
 
200 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  28.1 
 
 
193 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  30.15 
 
 
193 aa  52.8  0.000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  26.8 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  30.82 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  26.8 
 
 
193 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  27.15 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  31.76 
 
 
200 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  28.29 
 
 
165 aa  47.8  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  26.94 
 
 
200 aa  42.4  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  29.93 
 
 
203 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.103523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>