22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0395 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  100 
 
 
205 aa  397  9.999999999999999e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  35.06 
 
 
195 aa  92.8  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  35.06 
 
 
204 aa  79.3  0.00000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  34.39 
 
 
195 aa  73.6  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  32.02 
 
 
199 aa  73.9  0.000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  37.66 
 
 
203 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  35.9 
 
 
193 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  32.89 
 
 
195 aa  67.4  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  35.9 
 
 
193 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  30.77 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  33.14 
 
 
193 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3235  hypothetical protein  31.33 
 
 
220 aa  58.5  0.00000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.3467  normal  0.937712 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  32.34 
 
 
192 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  26.95 
 
 
202 aa  54.3  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  31.17 
 
 
194 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  27.27 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  28.57 
 
 
165 aa  50.4  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  30.77 
 
 
193 aa  49.7  0.00003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  25.87 
 
 
197 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  27.72 
 
 
200 aa  44.7  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  29.14 
 
 
194 aa  43.9  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  29.87 
 
 
190 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>