28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1628 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  100 
 
 		 199 aa  390  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  38.89 
 
 		 195 aa  128  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  47.97 
 
 		 195 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  36.95 
 
 		 195 aa  103  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  35.05 
 
 		 194 aa  99  4e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  33.33 
 
 		 203 aa  92  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  36.84 
 
 		 197 aa  87  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  30.2 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  32.8 
 
 		 200 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  28.8 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  31.28 
 
 		 200 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  34.21 
 
 		 205 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  31.21 
 
 		 194 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  32.7 
 
 		 194 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  32.48 
 
 		 192 aa  68.2  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  37.95 
 
 		 203 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  29.74 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  32.91 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  32.7 
 
 		 190 aa  62  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  29.32 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  30.97 
 
 		 165 aa  61.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  31.01 
 
 		 193 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  30.32 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1856  hypothetical protein  26.26 
 
 		 174 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.986469  normal  0.0497867 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3235  hypothetical protein  27.03 
 
 		 220 aa  48.1  0.00008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.3467  normal  0.937712 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4803  hypothetical protein  27.15 
 
 		 174 aa  46.2  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.360605  hitchhiker  0.000451592 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0334  hypothetical protein  26.63 
 
 		 203 aa  42.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.79896 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>