23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0422 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  395  1e-109  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  70.16 
 
 		 197 aa  264  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  37.95 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  32.09 
 
 		 195 aa  74.3  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  26.83 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  31.29 
 
 		 194 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  34.74 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  27.59 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  30.46 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  27.27 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1338  hypothetical protein  29.59 
 
 		 193 aa  52  0.000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  29.31 
 
 		 200 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  28.19 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  30.39 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  30.82 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  31.28 
 
 		 203 aa  48.5  0.00007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  26.18 
 
 		 193 aa  48.1  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  44.7  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  27.16 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0611  hypothetical protein  27.97 
 
 		 165 aa  43.1  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.895734 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  27.22 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0334  hypothetical protein  26.97 
 
 		 203 aa  42  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  26.83 
 
 		 192 aa  42  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>