22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1705 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 195 aa  380  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  56.99 
 
 		 195 aa  218  5e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  59.2 
 
 		 195 aa  179  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  47.98 
 
 		 194 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  36.95 
 
 		 199 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  32.12 
 
 		 203 aa  88.6  5e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  33.1 
 
 		 202 aa  85.5  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  32.89 
 
 		 205 aa  75.5  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  34.16 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  32.92 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  29.76 
 
 		 192 aa  70.1  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  32.65 
 
 		 197 aa  69.7  0.00000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  31.14 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  32.67 
 
 		 193 aa  68.2  0.00000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  35.17 
 
 		 204 aa  68.2  0.00000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  32.67 
 
 		 193 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  29.93 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  29.79 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  35.76 
 
 		 200 aa  62  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  58.2  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0773  hypothetical protein  33.06 
 
 		 387 aa  45.8  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.483211  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>