22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_3676 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  394  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  62.3 
 
 
200 aa  239  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  44.97 
 
 
200 aa  158  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  49.4 
 
 
194 aa  138  6e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  41.09 
 
 
200 aa  135  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  49.66 
 
 
190 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  31.28 
 
 
199 aa  82  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  29.29 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  37.84 
 
 
195 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  31.16 
 
 
193 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  25.37 
 
 
202 aa  56.2  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  35.76 
 
 
195 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0260  hypothetical protein  49.02 
 
 
110 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0108254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  28.8 
 
 
197 aa  55.1  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  30.98 
 
 
204 aa  51.2  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  30.15 
 
 
193 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  31.21 
 
 
194 aa  48.1  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  31.45 
 
 
203 aa  48.1  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  29.34 
 
 
193 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  28.26 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  26.42 
 
 
192 aa  45.1  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  28.93 
 
 
203 aa  42.4  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>