19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1089 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  100 
 
 
204 aa  410  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  35.06 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  32.34 
 
 
195 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  35.44 
 
 
195 aa  68.6  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  35.25 
 
 
194 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  31.34 
 
 
197 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  35.17 
 
 
195 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  29.32 
 
 
199 aa  60.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  34.44 
 
 
194 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  29.01 
 
 
194 aa  58.5  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  31.54 
 
 
203 aa  56.6  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  30 
 
 
193 aa  52  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  29.55 
 
 
200 aa  52  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  30.98 
 
 
200 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  33.1 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  23.65 
 
 
202 aa  48.1  0.00009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  29.3 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  28.74 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>