18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2668 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  100 
 
 
203 aa  402  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  34.54 
 
 
195 aa  92.4  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  33.33 
 
 
199 aa  92  5e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  34.9 
 
 
194 aa  84.7  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  32.12 
 
 
195 aa  81.6  0.000000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  37.74 
 
 
195 aa  78.2  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  37.66 
 
 
205 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  34.21 
 
 
192 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  33.55 
 
 
193 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  31.54 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  32.89 
 
 
193 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  29.94 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  31.85 
 
 
194 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  32 
 
 
194 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0334  hypothetical protein  27.1 
 
 
203 aa  47  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.675974  normal  0.79896 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  28.93 
 
 
197 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  26.29 
 
 
200 aa  46.2  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>