17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_2826 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  88.6 
 
 		 193 aa  339  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  87.05 
 
 		 193 aa  334  5e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  87.56 
 
 		 193 aa  317  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  47.85 
 
 		 194 aa  155  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  32.48 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  31.79 
 
 		 195 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  30.82 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  29.76 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  34.21 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  30.19 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  33.12 
 
 		 205 aa  56.6  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  31.54 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  27.4 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  27.27 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  29.95 
 
 		 197 aa  49.3  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  26.44 
 
 		 200 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.356911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>