23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2165 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2165  hypothetical protein  100 
 
 
194 aa  379  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.700991  normal  0.412034 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5924  hypothetical protein  88.95 
 
 
190 aa  283  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6972  hypothetical protein  44.15 
 
 
200 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000000112852  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3697  hypothetical protein  44.69 
 
 
200 aa  138  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.768044  hitchhiker  0.0000159971 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3676  hypothetical protein  46.7 
 
 
200 aa  137  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.356911 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5013  hypothetical protein  33.88 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.228518 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1086  hypothetical protein  33.87 
 
 
200 aa  82.8  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5848  hypothetical protein  35.42 
 
 
194 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.629993  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1628  hypothetical protein  32.46 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2150  hypothetical protein  36.77 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0957  hypothetical protein  26.32 
 
 
202 aa  68.9  0.00000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.113954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0482  hypothetical protein  28.42 
 
 
197 aa  67.8  0.00000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1705  hypothetical protein  32.42 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00494944  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2304  hypothetical protein  30.3 
 
 
193 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.915585 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3611  hypothetical protein  29.95 
 
 
193 aa  64.7  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.247774  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2826  hypothetical protein  30.82 
 
 
192 aa  64.7  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3108  hypothetical protein  31.87 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1089  hypothetical protein  34.44 
 
 
204 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.753829  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0395  hypothetical protein  31.17 
 
 
205 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.21361  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2668  hypothetical protein  29.27 
 
 
203 aa  52.8  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0260  hypothetical protein  37.97 
 
 
110 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0108254 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0422  hypothetical protein  26.45 
 
 
203 aa  49.3  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.103523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2030  hypothetical protein  28.19 
 
 
194 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>