More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3958 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3958  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
196 aa  390  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  90.72 
 
 
199 aa  356  9.999999999999999e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  79.38 
 
 
205 aa  316  2e-85  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4667  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.82 
 
 
196 aa  273  1.0000000000000001e-72  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
195 aa  228  3e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0761  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
196 aa  228  3e-59  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0842  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
196 aa  228  5e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_746  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
196 aa  223  1e-57  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000912325  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1569  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
202 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
196 aa  214  9e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.94 
 
 
195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
198 aa  211  5.999999999999999e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0107  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
196 aa  209  3e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1476  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
194 aa  209  3e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
195 aa  207  8e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
195 aa  206  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
200 aa  206  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
200 aa  206  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
197 aa  205  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.21 
 
 
197 aa  204  7e-52  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
196 aa  204  8e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
195 aa  204  8e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
197 aa  203  1e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
194 aa  204  1e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
195 aa  203  1e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
198 aa  202  2e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
195 aa  202  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
194 aa  202  3e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
194 aa  201  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.04 
 
 
195 aa  201  4e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
190 aa  202  4e-51  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.187196  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
195 aa  201  6e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5728  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
196 aa  201  6e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2895  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.03 
 
 
197 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000871701  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1310  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3685  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.841288 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
199 aa  199  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
201 aa  199  3e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.94 
 
 
197 aa  198  3e-50  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.67 
 
 
202 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.72 
 
 
197 aa  199  3e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.67 
 
 
202 aa  198  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.18 
 
 
202 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1152  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.03 
 
 
197 aa  197  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.740871  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.18 
 
 
198 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
201 aa  198  5e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
203 aa  197  6e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.94 
 
 
201 aa  197  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1130  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
195 aa  197  6e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1625  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
196 aa  197  7e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
201 aa  197  7e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
195 aa  197  7e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  197  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
197 aa  196  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
196 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2124  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  196  1.0000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.263885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0753  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
197 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
199 aa  196  2.0000000000000003e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
194 aa  195  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
195 aa  196  3e-49  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
197 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
194 aa  194  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
197 aa  194  5.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1333  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
191 aa  194  5.000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000182342  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
194 aa  194  6e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
197 aa  194  6e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.43 
 
 
202 aa  194  8.000000000000001e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3194  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.71 
 
 
203 aa  194  8.000000000000001e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297623  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
209 aa  194  9e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1527  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
194 aa  193  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
194 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
194 aa  193  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.69 
 
 
197 aa  193  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
194 aa  193  1e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3420  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.2 
 
 
203 aa  193  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
206 aa  193  1e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  194  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10890  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49 
 
 
199 aa  193  1e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
197 aa  193  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  193  1e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
206 aa  193  1e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.18 
 
 
197 aa  193  2e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  192  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1567  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
190 aa  193  2e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.578785 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
199 aa  192  2e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1566  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
194 aa  192  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>