More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0384 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
194 aa  399  9.999999999999999e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.88 
 
 
195 aa  276  1e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
196 aa  234  5.0000000000000005e-61  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
194 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.89 
 
 
196 aa  228  4e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
194 aa  228  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
194 aa  223  9e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  221  7e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.4 
 
 
196 aa  219  3e-56  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02210  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.26 
 
 
197 aa  218  3e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  218  5e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.33 
 
 
196 aa  217  1e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
195 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
198 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
194 aa  214  4e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.81 
 
 
195 aa  214  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.33 
 
 
195 aa  214  5.9999999999999996e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
199 aa  214  5.9999999999999996e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
194 aa  214  7e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.85 
 
 
197 aa  213  9e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1527  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  213  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1566  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1292  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  212  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
202 aa  211  7e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  210  1e-53  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
203 aa  209  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
195 aa  207  5e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
200 aa  206  1e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
202 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  206  2e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
206 aa  206  2e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
198 aa  206  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
198 aa  205  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1130  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  205  3e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
196 aa  205  3e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
195 aa  205  3e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
195 aa  205  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
197 aa  205  4e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
200 aa  204  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  204  7e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  204  9e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  203  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
203 aa  202  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
203 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
197 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
195 aa  202  3e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
203 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
201 aa  202  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
201 aa  202  4e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
198 aa  201  5e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
195 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
206 aa  201  5e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  201  8e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1476  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
194 aa  200  8e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.16 
 
 
199 aa  200  8e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2909  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
206 aa  200  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333324  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
205 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
197 aa  200  9.999999999999999e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0863  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.733546  normal  0.368952 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
202 aa  200  9.999999999999999e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0107  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.22 
 
 
196 aa  200  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0327334  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
195 aa  199  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
195 aa  198  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1989  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.04 
 
 
195 aa  198  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.706467  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
195 aa  198  3e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2895  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000871701  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  197  6e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  197  6e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.94 
 
 
202 aa  197  6e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  197  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  197  7e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.7 
 
 
199 aa  197  9e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>