More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2554 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.9 
 
 
195 aa  312  1.9999999999999998e-84  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.1 
 
 
197 aa  307  5e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.79 
 
 
195 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.79 
 
 
195 aa  304  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.59 
 
 
197 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.28 
 
 
195 aa  302  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.74 
 
 
195 aa  298  4e-80  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.07 
 
 
200 aa  295  3e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.59 
 
 
197 aa  294  7e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.59 
 
 
197 aa  291  3e-78  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.07 
 
 
200 aa  291  6e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.45 
 
 
202 aa  290  1e-77  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.57 
 
 
197 aa  290  1e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.45 
 
 
202 aa  290  1e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.1 
 
 
198 aa  289  2e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.9 
 
 
202 aa  289  2e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.94 
 
 
202 aa  289  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.56 
 
 
202 aa  287  7e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.04 
 
 
202 aa  286  1e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.07 
 
 
197 aa  285  2.9999999999999996e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.13 
 
 
202 aa  281  4.0000000000000003e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.96 
 
 
199 aa  279  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0126  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.53 
 
 
197 aa  278  3e-74  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.56 
 
 
195 aa  277  7e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.8 
 
 
203 aa  277  8e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.62 
 
 
195 aa  276  2e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.88 
 
 
197 aa  275  3e-73  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.64 
 
 
195 aa  270  1e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.62 
 
 
195 aa  268  2.9999999999999997e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.37 
 
 
196 aa  265  2e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.08 
 
 
198 aa  264  5e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.13 
 
 
195 aa  264  7e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.62 
 
 
195 aa  262  3e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.1 
 
 
195 aa  260  1e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.1 
 
 
195 aa  259  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.62 
 
 
195 aa  258  3e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.31 
 
 
206 aa  253  9e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.28 
 
 
206 aa  249  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.79 
 
 
199 aa  248  3e-65  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
198 aa  248  6e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  246  2e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
195 aa  246  2e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.79 
 
 
202 aa  245  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.79 
 
 
198 aa  245  4e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  244  4e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  245  4e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.28 
 
 
197 aa  244  6.999999999999999e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  244  8e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.39 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.31 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  241  6e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
195 aa  241  7e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  240  9e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3382  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.915315  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
195 aa  239  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
197 aa  239  2e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  238  4e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  238  4e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
199 aa  238  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  238  5e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
199 aa  238  5e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.41 
 
 
201 aa  237  5.999999999999999e-62  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  237  8e-62  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.25 
 
 
197 aa  237  9e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
209 aa  236  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
202 aa  236  1e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  237  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  236  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  235  3e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  235  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  234  4e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
201 aa  235  4e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2948  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.82 
 
 
204 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.44039  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
203 aa  234  5.0000000000000005e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
201 aa  234  8e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4375  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.82 
 
 
210 aa  231  6e-60  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.661676  normal  0.732346 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
197 aa  230  1e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>