More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3413 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
195 aa  241  5e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
195 aa  240  9e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
195 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.55 
 
 
196 aa  238  5e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.55 
 
 
194 aa  236  1e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  235  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.51 
 
 
195 aa  232  2.0000000000000002e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.31 
 
 
202 aa  231  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.59 
 
 
195 aa  231  4.0000000000000004e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.33 
 
 
200 aa  229  2e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.84 
 
 
200 aa  229  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.61 
 
 
198 aa  229  2e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  228  3e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.81 
 
 
202 aa  228  4e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.53 
 
 
198 aa  228  6e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  226  2e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.82 
 
 
209 aa  226  2e-58  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.99 
 
 
196 aa  226  2e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  225  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
195 aa  225  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  225  3e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
195 aa  225  3e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
202 aa  225  4e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
197 aa  224  8e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.99 
 
 
195 aa  224  9e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.02 
 
 
202 aa  224  9e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  223  1e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
202 aa  222  2e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
202 aa  222  2e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  222  2e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  221  4e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.04 
 
 
209 aa  220  8e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
202 aa  219  9.999999999999999e-57  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.51 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
196 aa  219  3e-56  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.99 
 
 
195 aa  219  3e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
194 aa  218  6e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.03 
 
 
198 aa  218  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
196 aa  216  1e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.03 
 
 
236 aa  215  2.9999999999999998e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.81 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  215  4e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
207 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
195 aa  214  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.81 
 
 
195 aa  214  7e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
199 aa  214  7e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
213 aa  214  7e-55  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
201 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.59 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0377  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.55 
 
 
200 aa  213  1.9999999999999998e-54  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.25 
 
 
202 aa  212  1.9999999999999998e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1553  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
198 aa  211  3.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  211  3.9999999999999995e-54  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
203 aa  211  3.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
198 aa  210  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  209  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0126  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  209  2e-53  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.78 
 
 
209 aa  209  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
208 aa  209  2e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0092  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
204 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
204 aa  208  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  208  3e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
201 aa  207  7e-53  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1133  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
199 aa  207  9e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1569  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
202 aa  207  1e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.01 
 
 
202 aa  206  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
195 aa  207  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
195 aa  206  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
197 aa  205  3e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0754  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.89 
 
 
196 aa  205  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
197 aa  205  4e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.99 
 
 
198 aa  204  5e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
205 aa  204  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.01 
 
 
201 aa  204  5e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1331  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.53 
 
 
202 aa  205  5e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.78 
 
 
194 aa  204  6e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
195 aa  204  6e-52  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
203 aa  204  7e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4667  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
196 aa  204  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.99 
 
 
206 aa  204  9e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.98 
 
 
206 aa  203  1e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
195 aa  203  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
201 aa  202  3e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1625  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
196 aa  202  3e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
197 aa  201  4e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.42 
 
 
197 aa  201  7e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.33 
 
 
194 aa  201  8e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0314  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.22 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0926  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.65 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0754281  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>