More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2884 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
195 aa  394  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.88 
 
 
194 aa  276  1e-73  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.28 
 
 
196 aa  272  2.0000000000000002e-72  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.84 
 
 
194 aa  262  2e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.54 
 
 
195 aa  254  5e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.08 
 
 
196 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.03 
 
 
195 aa  250  9.000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.03 
 
 
195 aa  250  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.51 
 
 
195 aa  244  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.97 
 
 
196 aa  244  6e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.18 
 
 
194 aa  244  6.999999999999999e-64  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1292  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.66 
 
 
194 aa  242  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.18 
 
 
194 aa  242  3e-63  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.07 
 
 
194 aa  241  6e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  240  9e-63  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  239  1e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  239  1e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  240  1e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1527  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  239  2e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.14 
 
 
194 aa  239  2e-62  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1566  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.57 
 
 
194 aa  239  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
195 aa  238  4e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  237  8e-62  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  236  1e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1130  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
195 aa  236  1e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  236  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  236  2e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
195 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
205 aa  233  2.0000000000000002e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0754  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.62 
 
 
196 aa  232  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.51 
 
 
197 aa  233  2.0000000000000002e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
194 aa  232  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
200 aa  231  5e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  230  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  229  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1476  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
194 aa  229  2e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3958  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
196 aa  228  3e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
201 aa  228  4e-59  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02210  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.07 
 
 
197 aa  227  9e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
201 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  226  2e-58  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
202 aa  226  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  226  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  224  4e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
198 aa  225  4e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
201 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  225  4e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  224  4e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
202 aa  224  4e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
202 aa  224  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  224  6e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  224  7e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  223  1e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0327334  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
198 aa  223  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0863  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  222  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.733546  normal  0.368952 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
199 aa  222  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
213 aa  221  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  221  4.9999999999999996e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
198 aa  221  6e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1133  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
206 aa  220  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
196 aa  218  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  218  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
198 aa  218  6e-56  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
201 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
197 aa  217  8.999999999999998e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
201 aa  215  2.9999999999999998e-55  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
202 aa  215  4e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
208 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
195 aa  215  4e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
198 aa  214  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
199 aa  214  5e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2124  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  214  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.263885  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
206 aa  214  5.9999999999999996e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
198 aa  214  7e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
203 aa  213  9.999999999999999e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
202 aa  213  9.999999999999999e-55  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0188  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
206 aa  213  9.999999999999999e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
209 aa  212  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  212  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1553  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  213  1.9999999999999998e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
201 aa  212  1.9999999999999998e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1331  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.55 
 
 
202 aa  212  2.9999999999999995e-54  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  212  2.9999999999999995e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>