More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3040 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
195 aa  402  1e-111  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  73.85 
 
 
195 aa  309  2e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.31 
 
 
195 aa  305  3e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.36 
 
 
195 aa  305  3e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.31 
 
 
195 aa  305  3e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.26 
 
 
195 aa  298  2e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.74 
 
 
195 aa  297  7e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.62 
 
 
195 aa  269  2e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  244  4.9999999999999997e-64  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
195 aa  238  2.9999999999999997e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0327334  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.46 
 
 
196 aa  238  4e-62  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
199 aa  236  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
199 aa  236  1e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
195 aa  236  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  231  6e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  230  1e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0188  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
206 aa  230  1e-59  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
197 aa  230  1e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.61 
 
 
196 aa  229  2e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  229  2e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.61 
 
 
196 aa  228  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.61 
 
 
196 aa  229  3e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  228  5e-59  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0377  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
200 aa  227  7e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
197 aa  227  8e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
196 aa  227  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  227  9e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
197 aa  227  9e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
198 aa  226  1e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
197 aa  226  1e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
198 aa  226  1e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  226  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  225  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
199 aa  225  3e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
197 aa  225  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
197 aa  225  4e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1553  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
195 aa  224  5.0000000000000005e-58  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
197 aa  224  6e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.03 
 
 
194 aa  224  6e-58  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
196 aa  224  7e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
198 aa  224  9e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
200 aa  223  1e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  223  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  223  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  222  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  223  2e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  223  2e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
196 aa  222  3e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0323  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  222  3e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.352379  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
197 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5338  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4897  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  221  4e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  221  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  221  4e-57  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
197 aa  221  4e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
203 aa  221  4.9999999999999996e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  221  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  220  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  220  8e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  220  9e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
200 aa  220  9e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
202 aa  219  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
194 aa  219  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
199 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  219  9.999999999999999e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0289  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000174481 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
194 aa  219  1.9999999999999999e-56  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0309  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
210 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.7048  decreased coverage  0.00641142 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.37 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
201 aa  218  3.9999999999999997e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
202 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
197 aa  218  5e-56  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
206 aa  218  6e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  218  7e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.33 
 
 
194 aa  217  8.999999999999998e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
201 aa  216  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.85 
 
 
198 aa  216  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  216  1e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0314  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  216  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
197 aa  216  2e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>