More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2353 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
196 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0754  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.82 
 
 
196 aa  259  2e-68  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.08 
 
 
195 aa  253  1.0000000000000001e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
196 aa  250  1e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.62 
 
 
194 aa  242  3e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.59 
 
 
194 aa  241  3.9999999999999997e-63  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.31 
 
 
195 aa  238  5e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.18 
 
 
196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.79 
 
 
213 aa  232  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
195 aa  231  7.000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
195 aa  230  8.000000000000001e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  229  1e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1625  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.65 
 
 
196 aa  229  2e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.88 
 
 
197 aa  228  3e-59  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  228  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
203 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
203 aa  228  5e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.18 
 
 
196 aa  227  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  227  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.61 
 
 
202 aa  226  1e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
209 aa  226  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3413  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.99 
 
 
199 aa  226  2e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.901553  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
201 aa  225  3e-58  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
201 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.67 
 
 
196 aa  225  4e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
201 aa  224  6e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
194 aa  224  6e-58  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.99 
 
 
195 aa  224  7e-58  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  224  7e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
197 aa  223  1e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  223  1e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
202 aa  223  1e-57  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
207 aa  223  1e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.63 
 
 
198 aa  223  1e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.16 
 
 
196 aa  223  2e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  223  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
196 aa  222  2e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
201 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  222  3e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
197 aa  221  4e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  221  6e-57  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
198 aa  221  8e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0089  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.35 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.922879  normal  0.290643 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.82 
 
 
197 aa  220  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0092  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.35 
 
 
204 aa  220  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.84 
 
 
197 aa  220  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0327334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
198 aa  219  1.9999999999999999e-56  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
197 aa  219  1.9999999999999999e-56  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.4 
 
 
194 aa  219  3e-56  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  219  3e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.35 
 
 
197 aa  218  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2687  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
209 aa  218  5e-56  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  218  6e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
198 aa  218  6e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4004  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
197 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.317891  normal  0.463755 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  217  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  217  8.999999999999998e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.48 
 
 
194 aa  217  1e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  216  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
236 aa  216  2e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
197 aa  216  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.06 
 
 
208 aa  215  2.9999999999999998e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1498  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
194 aa  215  2.9999999999999998e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  215  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1318  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
194 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1291  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
194 aa  215  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
194 aa  215  4e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1130  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
195 aa  215  4e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  214  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
209 aa  214  5e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1292  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
194 aa  214  7e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.44 
 
 
194 aa  214  7e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1566  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.96 
 
 
194 aa  214  7e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  214  7e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1329  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.92 
 
 
194 aa  214  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
195 aa  214  9e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4919  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.81 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.608103  hitchhiker  0.001484 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02210  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.79 
 
 
197 aa  213  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0314  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.33 
 
 
194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.37 
 
 
194 aa  212  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  212  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>