More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_1237 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
203 aa  422  1e-117  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.82 
 
 
199 aa  310  7.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.56 
 
 
195 aa  286  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.8 
 
 
197 aa  277  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.4 
 
 
195 aa  275  3e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.19 
 
 
202 aa  274  6e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.45 
 
 
198 aa  272  2.0000000000000002e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.19 
 
 
202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.24 
 
 
202 aa  271  4.0000000000000004e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.1 
 
 
197 aa  270  7e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.8 
 
 
200 aa  270  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.8 
 
 
200 aa  269  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.24 
 
 
197 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.93 
 
 
202 aa  266  1e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.81 
 
 
202 aa  266  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.81 
 
 
202 aa  266  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.31 
 
 
202 aa  265  2e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.37 
 
 
196 aa  261  4e-69  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.78 
 
 
197 aa  261  4e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0126  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.1 
 
 
197 aa  260  1e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.73 
 
 
197 aa  259  2e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.27 
 
 
197 aa  258  3e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.31 
 
 
195 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.08 
 
 
197 aa  258  4e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.34 
 
 
195 aa  258  5.0000000000000005e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.79 
 
 
195 aa  257  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.27 
 
 
197 aa  255  3e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
195 aa  255  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
195 aa  255  4e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.71 
 
 
197 aa  253  9e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
195 aa  245  3e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.63 
 
 
198 aa  245  4e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.7 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
198 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
195 aa  242  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  237  6.999999999999999e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  235  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  234  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
206 aa  229  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
203 aa  227  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
203 aa  227  8e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  227  8e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
206 aa  226  2e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
202 aa  225  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  225  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.67 
 
 
199 aa  225  3e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  225  4e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  223  1e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.27 
 
 
201 aa  223  1e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.78 
 
 
201 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.26 
 
 
201 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  223  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
198 aa  223  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  223  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
196 aa  223  2e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
196 aa  222  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  222  3e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
195 aa  221  6e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67930  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0820983  normal  0.0255307 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5879  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  221  6e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.971219  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  221  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
196 aa  220  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
195 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.23 
 
 
201 aa  220  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
197 aa  218  3e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
201 aa  219  3e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
197 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  219  3e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  218  3e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
197 aa  219  3e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.04 
 
 
197 aa  218  5e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.27 
 
 
201 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1413  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
196 aa  218  5e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
197 aa  218  5e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  218  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
199 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
199 aa  217  7.999999999999999e-56  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.75 
 
 
209 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  216  1e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  217  1e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
197 aa  216  2e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  216  2e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
196 aa  216  2e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>