More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3149 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
195 aa  405  1.0000000000000001e-112  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.31 
 
 
195 aa  304  7e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1006  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.74 
 
 
197 aa  289  2e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.64 
 
 
199 aa  281  3.0000000000000004e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.62 
 
 
197 aa  276  2e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.4 
 
 
203 aa  275  2e-73  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
195 aa  270  1e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.82 
 
 
200 aa  269  2e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
195 aa  269  2e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  267  8e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.03 
 
 
195 aa  266  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.86 
 
 
200 aa  266  2e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.03 
 
 
197 aa  260  8e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.28 
 
 
202 aa  257  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.03 
 
 
197 aa  256  1e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
202 aa  252  2.0000000000000002e-66  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
202 aa  252  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.25 
 
 
202 aa  252  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.76 
 
 
202 aa  252  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
198 aa  251  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  249  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.73 
 
 
196 aa  248  3e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
195 aa  248  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.92 
 
 
195 aa  246  2e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
195 aa  245  3e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.22 
 
 
202 aa  244  6e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0122  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.56 
 
 
197 aa  243  9.999999999999999e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
202 aa  241  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0126  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.51 
 
 
197 aa  241  7e-63  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.299288 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  239  2e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0415  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
197 aa  238  4e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0311  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
197 aa  237  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0405  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
197 aa  238  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.569692 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
198 aa  236  1e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
195 aa  237  1e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2293  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.95 
 
 
197 aa  234  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.573813 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
198 aa  234  8e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.87 
 
 
195 aa  233  9e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
195 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.15 
 
 
206 aa  230  1e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  228  5e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
206 aa  226  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
202 aa  224  6e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.64 
 
 
197 aa  224  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1966  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
195 aa  223  1e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.768951  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0519  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
197 aa  223  2e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.881117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0487  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
197 aa  222  3e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
201 aa  222  3e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
201 aa  221  4e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  221  4.9999999999999996e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.627286  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0111  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
198 aa  221  7e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0398099  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
199 aa  221  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
199 aa  221  7e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
199 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
201 aa  219  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
196 aa  219  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  218  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0108  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.926859 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3558  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.451024  hitchhiker  0.0000499164 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  218  6e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
208 aa  218  6e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.912882  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
196 aa  217  7e-56  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
197 aa  217  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.319275 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
207 aa  217  7e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
197 aa  217  7.999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH01620  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase, putative  55.28 
 
 
202 aa  217  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
194 aa  217  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2805  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
197 aa  216  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25121  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
209 aa  217  1e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04590  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
197 aa  217  1e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3691  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  1e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
196 aa  217  1e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01115  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  53.09 
 
 
356 aa  216  1e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.836932  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0213  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
197 aa  216  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3722  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.596949  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1944  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  54.64 
 
 
355 aa  216  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3664  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  216  2e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2927  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  53.61 
 
 
374 aa  215  2.9999999999999998e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4256  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.48 
 
 
197 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000104462 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
203 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0817  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  215  4e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
236 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
203 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2544  imidazole glycerol-phosphate dehydratase/histidinol phosphatase  54.64 
 
 
355 aa  215  4e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
201 aa  215  4e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  215  4e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  214  5e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
197 aa  214  5.9999999999999996e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.177409  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
203 aa  214  7e-55  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>