More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5728 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5728  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
196 aa  391  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1152  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.68 
 
 
197 aa  324  4.0000000000000003e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.740871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2909  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  77.44 
 
 
206 aa  311  2.9999999999999996e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3190  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  80.2 
 
 
225 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1436  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.07 
 
 
211 aa  299  2e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.540347 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2895  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  72.08 
 
 
197 aa  296  1e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000871701  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3025  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.39 
 
 
195 aa  268  5e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  0.0729461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1918  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.88 
 
 
195 aa  268  5.9999999999999995e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.63685  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.98 
 
 
206 aa  246  2e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143401  normal  0.108014 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3420  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.22 
 
 
203 aa  245  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3175  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.83 
 
 
199 aa  244  4.9999999999999997e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3194  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.25 
 
 
203 aa  242  1.9999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297623  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10890  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.8 
 
 
199 aa  241  5e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3240  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.13 
 
 
198 aa  239  2e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3995  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.2 
 
 
203 aa  237  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  normal  0.390743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.9 
 
 
202 aa  235  4e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1093  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.93 
 
 
203 aa  232  3e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.508582  normal  0.692813 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3161  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.3 
 
 
199 aa  231  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00168053  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1471  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.1 
 
 
208 aa  230  9e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31387  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5720  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
200 aa  227  7e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07360  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.9 
 
 
205 aa  226  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1473  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.6 
 
 
208 aa  226  1e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000724097 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1614  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.9 
 
 
207 aa  225  3e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.478967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2958  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.72 
 
 
204 aa  225  4e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.194026  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.46 
 
 
202 aa  223  1e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0862728  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.49 
 
 
195 aa  222  3e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.73 
 
 
208 aa  221  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22540  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.14 
 
 
204 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3061  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.22 
 
 
208 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3077  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.22 
 
 
208 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.22 
 
 
208 aa  221  6e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.44 
 
 
197 aa  220  9e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.63 
 
 
200 aa  218  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2392  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.63 
 
 
204 aa  217  1e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.103762  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
202 aa  214  5e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.32 
 
 
210 aa  213  9.999999999999999e-55  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
195 aa  213  9.999999999999999e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
198 aa  212  2.9999999999999995e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
202 aa  212  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1308  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.82 
 
 
199 aa  211  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
200 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
194 aa  209  2e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.65 
 
 
199 aa  209  3e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  208  3e-53  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.54 
 
 
195 aa  209  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.9 
 
 
202 aa  208  4e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2025  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.72 
 
 
204 aa  208  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0154  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.27 
 
 
199 aa  208  5e-53  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.135927  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
195 aa  208  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.38 
 
 
206 aa  208  5e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.53 
 
 
195 aa  207  6e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.54 
 
 
195 aa  207  6e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
198 aa  206  1e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
202 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  205  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.28 
 
 
196 aa  204  5e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
196 aa  203  1e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.51 
 
 
195 aa  203  1e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.98 
 
 
196 aa  203  1e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.36 
 
 
198 aa  203  1e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
195 aa  202  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
195 aa  202  2e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
206 aa  203  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
195 aa  202  3e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2938  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.76 
 
 
198 aa  202  3e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  202  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.81 
 
 
197 aa  201  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
199 aa  202  4e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0304  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.28 
 
 
197 aa  201  4e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21990  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.9 
 
 
214 aa  201  4e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.732352  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3958  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.3 
 
 
196 aa  201  6e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03041  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
201 aa  201  6e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.08 
 
 
205 aa  200  8e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.01 
 
 
196 aa  199  9.999999999999999e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.82 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
197 aa  198  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0842  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.33 
 
 
196 aa  198  5e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
195 aa  198  5e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.04 
 
 
202 aa  197  6e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.04 
 
 
202 aa  197  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
196 aa  197  7.999999999999999e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
202 aa  197  9e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.27 
 
 
199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.57 
 
 
203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.27 
 
 
199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.27 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
202 aa  196  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
201 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_746  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.79 
 
 
196 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000912325  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0283  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
201 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603914  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0109  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  195  3e-49  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.228917  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03051  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
201 aa  195  3e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.299371  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1569  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.12 
 
 
202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4667  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.76 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5520  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.55 
 
 
201 aa  194  5.000000000000001e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.329612  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>