More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1093 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013174  Jden_1093  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
203 aa  404  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.508582  normal  0.692813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1614  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  82.74 
 
 
207 aa  331  4e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.478967 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22540  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  87.31 
 
 
204 aa  329  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3175  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  81.22 
 
 
199 aa  324  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1473  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  79.4 
 
 
208 aa  323  8.000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000724097 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1471  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  78.68 
 
 
208 aa  319  9.999999999999999e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2392  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  79.7 
 
 
204 aa  314  5e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.103762  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07360  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.13 
 
 
205 aa  308  4e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0154  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  76.14 
 
 
199 aa  307  5.9999999999999995e-83  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.135927  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1308  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  84.26 
 
 
199 aa  304  6e-82  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21990  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.24 
 
 
214 aa  286  1e-76  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.732352  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.5 
 
 
202 aa  277  7e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10890  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.45 
 
 
199 aa  258  5.0000000000000005e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5720  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.14 
 
 
200 aa  256  1e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2958  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.38 
 
 
204 aa  255  3e-67  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.194026  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3025  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.33 
 
 
195 aa  248  4e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  0.0729461 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
202 aa  246  1e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0862728  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
208 aa  245  3e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3061  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.59 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3077  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.59 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.59 
 
 
208 aa  244  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1918  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.82 
 
 
195 aa  244  6.999999999999999e-64  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.63685  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3161  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.42 
 
 
199 aa  242  3e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00168053  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2025  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.69 
 
 
204 aa  238  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.14 
 
 
206 aa  238  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143401  normal  0.108014 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1152  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.42 
 
 
197 aa  237  9e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.740871  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2909  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
206 aa  237  1e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333324  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2895  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.91 
 
 
197 aa  235  3e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000871701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.05 
 
 
210 aa  234  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5728  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.93 
 
 
196 aa  232  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3240  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.16 
 
 
198 aa  231  5e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1436  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.38 
 
 
211 aa  229  2e-59  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.540347 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3190  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.18 
 
 
225 aa  227  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
197 aa  204  1e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3995  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.86 
 
 
203 aa  201  5e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  normal  0.390743 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.05 
 
 
197 aa  201  6e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3194  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.41 
 
 
203 aa  201  8e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297623  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.74 
 
 
197 aa  199  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3420  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.41 
 
 
203 aa  199  3e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
195 aa  198  5e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.02 
 
 
195 aa  197  7.999999999999999e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.72 
 
 
195 aa  195  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  194  8.000000000000001e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0107  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.75 
 
 
196 aa  194  1e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
195 aa  193  1e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0835  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.53 
 
 
193 aa  193  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.81817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
196 aa  193  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.78 
 
 
194 aa  192  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  193  2e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.73 
 
 
195 aa  192  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
195 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
195 aa  192  4e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1767  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.72 
 
 
197 aa  191  5e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.239595  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.52 
 
 
198 aa  191  8e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.48 
 
 
195 aa  189  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0661  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.74 
 
 
196 aa  189  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.97 
 
 
196 aa  189  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  43.65 
 
 
196 aa  188  5e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
195 aa  188  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.01 
 
 
202 aa  187  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.31 
 
 
206 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2124  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.79 
 
 
195 aa  187  8e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.263885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.51 
 
 
202 aa  187  9e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3525  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.26 
 
 
195 aa  186  1e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.283868 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.25 
 
 
195 aa  187  1e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
197 aa  186  2e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.46 
 
 
194 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0330  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
195 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.843047  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48 
 
 
197 aa  186  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0354  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
195 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.332869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.04 
 
 
202 aa  186  3e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0345  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
195 aa  186  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.69324  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.97 
 
 
195 aa  185  4e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2000  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.21 
 
 
196 aa  185  4e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.628032  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1333  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.24 
 
 
191 aa  185  4e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000182342  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1711  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
195 aa  184  5e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0251  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.26 
 
 
198 aa  184  5e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000155006  normal  0.0277595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49 
 
 
206 aa  185  5e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0406  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.77 
 
 
195 aa  184  7e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.186972 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3227  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.26 
 
 
196 aa  184  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.99 
 
 
197 aa  184  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2680  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.77 
 
 
195 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.63199  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0427  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.77 
 
 
195 aa  184  9e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.26 
 
 
202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2880  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.26 
 
 
196 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0502764 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.57 
 
 
203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0377  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.5 
 
 
200 aa  184  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.97 
 
 
195 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2950  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.26 
 
 
196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2712  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.78 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2757  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.28 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.28 
 
 
202 aa  183  2.0000000000000003e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2991  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.28 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.922972  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.76 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.98 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0400  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.28 
 
 
195 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2763  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.78 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1790  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.78 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3241  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.78 
 
 
195 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>