More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2958 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2958  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
204 aa  416  9.999999999999999e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.194026  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2025  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  80.39 
 
 
204 aa  327  6e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3077  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.12 
 
 
208 aa  310  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3061  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.12 
 
 
208 aa  310  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.12 
 
 
208 aa  310  6.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  75.12 
 
 
208 aa  307  5.9999999999999995e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.13 
 
 
202 aa  304  8.000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0862728  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  74.35 
 
 
210 aa  293  2e-78  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10890  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  69.15 
 
 
199 aa  288  3e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3161  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.67 
 
 
199 aa  278  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00168053  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5720  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.84 
 
 
200 aa  269  2e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1093  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.38 
 
 
203 aa  255  3e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.508582  normal  0.692813 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3175  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.19 
 
 
199 aa  254  8e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0154  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.19 
 
 
199 aa  248  6e-65  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.135927  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3025  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.7 
 
 
195 aa  247  8e-65  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  0.0729461 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.7 
 
 
202 aa  244  6e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1918  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.7 
 
 
195 aa  243  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.63685  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2895  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.21 
 
 
197 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000871701  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2392  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.56 
 
 
204 aa  239  2e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.103762  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1614  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.7 
 
 
207 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.478967 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1471  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.21 
 
 
208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31387  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1152  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.71 
 
 
197 aa  236  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.740871  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21990  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.9 
 
 
214 aa  236  2e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.732352  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1473  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.71 
 
 
208 aa  235  3e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000724097 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07360  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.71 
 
 
205 aa  233  1.0000000000000001e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3190  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.7 
 
 
225 aa  231  5e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2909  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.72 
 
 
206 aa  228  4e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333324  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22540  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.69 
 
 
204 aa  227  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  57.14 
 
 
206 aa  227  9e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143401  normal  0.108014 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1436  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  58.03 
 
 
211 aa  227  1e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.540347 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3240  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.4 
 
 
198 aa  226  2e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5728  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.72 
 
 
196 aa  225  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  54.73 
 
 
194 aa  217  7e-56  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1308  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.69 
 
 
199 aa  215  2.9999999999999998e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3194  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.4 
 
 
203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297623  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3420  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.92 
 
 
203 aa  210  1e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3995  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.4 
 
 
203 aa  204  6e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  normal  0.390743 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
195 aa  202  2e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
195 aa  203  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.5 
 
 
195 aa  197  9e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
199 aa  196  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.7 
 
 
197 aa  195  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.5 
 
 
197 aa  195  3e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.26 
 
 
196 aa  195  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.5 
 
 
195 aa  195  4.0000000000000005e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
198 aa  195  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.02 
 
 
196 aa  194  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1474  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.75 
 
 
196 aa  192  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.454661 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.49 
 
 
195 aa  192  4e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.09 
 
 
195 aa  192  4e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0327334  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.76 
 
 
195 aa  192  4e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3958  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.99 
 
 
196 aa  191  5e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.160905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.99 
 
 
205 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.25 
 
 
195 aa  191  8e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.53 
 
 
196 aa  189  2e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.26 
 
 
206 aa  189  2e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2001  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.53 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.49434  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2081  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.53 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.974158  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1569  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.27 
 
 
202 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.02 
 
 
200 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  normal  0.555975 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4308  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.77 
 
 
202 aa  188  4e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.27 
 
 
206 aa  187  7e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1333  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.98 
 
 
191 aa  187  7e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000182342  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0107  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.02 
 
 
196 aa  187  7e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4667  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.5 
 
 
196 aa  187  8e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0863  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  187  9e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.733546  normal  0.368952 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2124  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  187  1e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.263885  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.78 
 
 
202 aa  187  1e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1460  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.21 
 
 
194 aa  187  1e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.76 
 
 
195 aa  187  1e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.28 
 
 
196 aa  186  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.02 
 
 
195 aa  186  2e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0838  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.55 
 
 
202 aa  186  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.03 
 
 
195 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.02 
 
 
195 aa  186  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1310  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.26 
 
 
191 aa  185  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.382383 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.26 
 
 
195 aa  185  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.04 
 
 
200 aa  185  5e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0835  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.24 
 
 
193 aa  185  5e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.81817  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1003  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
194 aa  184  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.02 
 
 
195 aa  184  6e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1589  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.04 
 
 
203 aa  184  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00273051 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.02 
 
 
195 aa  184  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.52 
 
 
195 aa  184  7e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.01 
 
 
195 aa  184  7e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0761  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.8 
 
 
196 aa  184  8e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3493  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.83 
 
 
202 aa  184  8e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.52 
 
 
195 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.52 
 
 
194 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.69 
 
 
194 aa  182  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0833  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.02 
 
 
199 aa  182  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0326052  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1203  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.05 
 
 
194 aa  182  4.0000000000000006e-45  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.02 
 
 
195 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.77 
 
 
197 aa  181  6e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  45.81 
 
 
198 aa  181  6e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.34 
 
 
197 aa  181  7e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  46.38 
 
 
202 aa  181  8.000000000000001e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.51 
 
 
199 aa  181  9.000000000000001e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.03 
 
 
195 aa  180  1e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.73 
 
 
194 aa  180  1e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>