More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_1918 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_1918  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  100 
 
 
195 aa  389  1e-107  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.63685  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3025  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  89.23 
 
 
195 aa  359  1e-98  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.457196  normal  0.0729461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1060  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  71.5 
 
 
206 aa  279  2e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.143401  normal  0.108014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2895  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.53 
 
 
197 aa  273  1.0000000000000001e-72  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000871701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5728  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.88 
 
 
196 aa  268  5e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2909  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  68.21 
 
 
206 aa  266  1e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0333324  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3190  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  70.05 
 
 
225 aa  264  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.103059  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1152  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.5 
 
 
197 aa  261  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.740871  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.84 
 
 
202 aa  259  2e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3175  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  66.17 
 
 
199 aa  255  2e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1436  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.38 
 
 
211 aa  255  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.540347 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10890  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.8 
 
 
199 aa  254  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.95344  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3194  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.55 
 
 
203 aa  253  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297623  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3420  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.53 
 
 
203 aa  253  2.0000000000000002e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0173551 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.9 
 
 
202 aa  249  2e-65  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0862728  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.2 
 
 
208 aa  249  3e-65  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3077  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61 
 
 
208 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.288145 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3061  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61 
 
 
208 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578929  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3120  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61 
 
 
208 aa  247  1e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11617  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.68 
 
 
210 aa  246  2e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.241094 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1093  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.82 
 
 
203 aa  244  6.999999999999999e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.508582  normal  0.692813 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1614  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.32 
 
 
207 aa  243  9.999999999999999e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.478967 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2958  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.7 
 
 
204 aa  243  1.9999999999999999e-63  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.194026  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3240  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  65.15 
 
 
198 aa  242  1.9999999999999999e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3161  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60.8 
 
 
199 aa  240  9e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00168053  hitchhiker  0.000169834 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1471  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
208 aa  239  2e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.31387  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2392  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  67.84 
 
 
204 aa  238  5e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.103762  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1473  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  60 
 
 
208 aa  237  8e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000724097 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5720  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.5 
 
 
200 aa  236  2e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0154  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.3 
 
 
199 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.135927  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3995  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  63.24 
 
 
203 aa  231  5e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.894769  normal  0.390743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2025  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.2 
 
 
204 aa  226  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07360  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  59.3 
 
 
205 aa  226  1e-58  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22540  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  62.81 
 
 
204 aa  226  2e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.863031  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21990  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  61.42 
 
 
214 aa  220  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.732352  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1308  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  64.5 
 
 
199 aa  214  5e-55  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2784  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
196 aa  213  9.999999999999999e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1883  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  56.19 
 
 
195 aa  210  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.61 
 
 
195 aa  207  7e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.725915  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15260  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.3 
 
 
194 aa  206  2e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.802497  normal  0.249652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2554  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
197 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2249  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.504949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0794  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.09 
 
 
195 aa  204  9e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0399924  normal  0.805329 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2034  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.72 
 
 
196 aa  202  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2353  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
196 aa  202  3e-51  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.11788  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2246  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  201  5e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2788  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
195 aa  201  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.391229  normal  0.69418 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4056  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
195 aa  201  6e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.738994  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0921  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
195 aa  201  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0124066  normal  0.0565449 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2717  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.31 
 
 
195 aa  200  9e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2771  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  200  9e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.259514  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1647  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2548  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0125  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
209 aa  200  9.999999999999999e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03611  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
203 aa  200  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.140902  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3703  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.04 
 
 
195 aa  200  9.999999999999999e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3098  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2478  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
195 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0104295 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1619  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  53.85 
 
 
198 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1168  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
202 aa  199  3e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0698  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.55 
 
 
206 aa  198  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1237  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.49 
 
 
203 aa  198  5e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.817339 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0806  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
206 aa  198  5e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4906  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
236 aa  197  6e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0247  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.06 
 
 
201 aa  197  7e-50  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3798  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
195 aa  197  7e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2033  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
195 aa  197  9e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.792385 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3173  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
197 aa  197  1.0000000000000001e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0386  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.02 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3149  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1094  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  52.58 
 
 
197 aa  196  3e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0429  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
207 aa  196  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.554154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1494  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
194 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2884  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.72 
 
 
195 aa  195  3e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.008915  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5045  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.98 
 
 
196 aa  195  3e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.223835 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0220  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.53 
 
 
202 aa  194  5.000000000000001e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1081  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.52 
 
 
197 aa  194  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000121511 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3285  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.25 
 
 
209 aa  193  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0384  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.7 
 
 
194 aa  193  1e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3155  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.21 
 
 
196 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03141  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.69 
 
 
201 aa  193  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7533  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.77 
 
 
200 aa  192  2e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.757131  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0467  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
195 aa  192  2e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3263  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
202 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1063  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
198 aa  192  3e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.179926  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3530  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50.26 
 
 
198 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00738579  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1333  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.74 
 
 
191 aa  191  6e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000000182342  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0125  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.03 
 
 
197 aa  191  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1413  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  55.1 
 
 
196 aa  191  8e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3040  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.69 
 
 
195 aa  190  9e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000415747  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0825  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  47.69 
 
 
195 aa  190  1e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00384166  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2978  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.72 
 
 
195 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00102167  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3981  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.21 
 
 
202 aa  190  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2584  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  51.28 
 
 
205 aa  189  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00305214 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0377  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  49.23 
 
 
200 aa  189  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.110451 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0148  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
197 aa  189  2e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2028  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.45 
 
 
213 aa  189  2e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.476517  normal  0.112404 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3043  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3597  imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  48.97 
 
 
199 aa  188  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2652  Imidazoleglycerol-phosphate dehydratase  50 
 
 
199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>