120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1624 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1624  remnant of A ISRSO16-transposase ORFA protein  100 
 
 		 71 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1629  C-terminus of TISRSO16 ORFA transposase protein  100 
 
 		 71 aa  140  8e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  97.14 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0088  hypothetical protein  65.96 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00165829  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0548  hypothetical protein  65.96 
 
 		 50 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  77.14 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  77.14 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  77.14 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  77.14 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  77.14 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2241  transposase  62.22 
 
 		 49 aa  55.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  77.14 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  77.14 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  77.14 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  77.14 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  71.43 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2060  transposase  62.22 
 
 		 49 aa  55.1  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125983  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  46.75 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  46.75 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  46.75 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  74.29 
 
 		 359 aa  53.9  0.0000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  74.29 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  46.97 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  46.97 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  46.97 
 
 		 88 aa  51.6  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  65.71 
 
 		 99 aa  52  0.000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  68.57 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  71.43 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1637  hypothetical protein  65.71 
 
 		 102 aa  51.2  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5733  hypothetical protein  60 
 
 		 72 aa  51.2  0.000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115399  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0659  transposase IS3/IS911 family protein  68.57 
 
 		 59 aa  51.2  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.335609  normal  0.0301551 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  45.45 
 
 		 88 aa  50.4  0.000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  62.86 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  60 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  40.26 
 
 		 88 aa  48.9  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  44.44 
 
 		 88 aa  47.8  0.00006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  41.56 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  58.82 
 
 		 87 aa  45.8  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  40.91 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  61.76 
 
 		 93 aa  45.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  40.91 
 
 		 362 aa  45.1  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2882  hypothetical protein  67.74 
 
 		 99 aa  44.3  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663087  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1114  ISRSO16-transposase OrfA protein  67.74 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2730  isrso12-transposase orfa  67.74 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  54.29 
 
 		 85 aa  43.9  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 370 aa  43.9  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  39.34 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  39.39 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  40.91 
 
 		 362 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  40.98 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  35.53 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  39.34 
 
 		 88 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  57.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  57.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  57.14 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  54.29 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  41.67 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0079  IS407A, transposase OrfA  58.82 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0747988  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  57.14 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  57.14 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 362 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  51.43 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  51.43 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1093  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1610  transposase IS3/IS911 family protein  58.82 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.111694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  51.43 
 
 		 88 aa  42.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0083  ISDet1, transposase orfA  51.43 
 
 		 88 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.376944  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  55.88 
 
 		 88 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  54.29 
 
 		 88 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4851  transposase IS3/IS911 family protein  55.88 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0283322 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>