More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3761 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  100 
 
 
88 aa  181  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  92.05 
 
 
88 aa  169  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  85.23 
 
 
88 aa  159  8.000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  73.86 
 
 
88 aa  145  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  75 
 
 
88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  75 
 
 
88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  75 
 
 
88 aa  143  7.0000000000000006e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  70.45 
 
 
88 aa  138  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 
88 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 
88 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 
88 aa  137  7e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  69.77 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  61.36 
 
 
88 aa  128  3e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  60.23 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  60.23 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  61.36 
 
 
88 aa  126  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  66.28 
 
 
362 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  66.28 
 
 
362 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  66.28 
 
 
362 aa  124  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  63.22 
 
 
492 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  62.79 
 
 
87 aa  123  9e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  66.28 
 
 
88 aa  122  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  57.95 
 
 
88 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  61.63 
 
 
93 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  65.12 
 
 
88 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  61.73 
 
 
399 aa  115  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  65.48 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  65.48 
 
 
88 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  104  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
370 aa  103  9e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
96 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
96 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
96 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  48.84 
 
 
96 aa  100  5e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  100  6e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  58.75 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  52.33 
 
 
87 aa  99.4  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  99  2e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  52.33 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  52.33 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3628  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 
88 aa  97.4  6e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00241648  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  52.44 
 
 
86 aa  97.1  8e-20  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  95.5  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0137  transposase IS3/IS911  48.81 
 
 
87 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1300  transposase IS3/IS911  48.81 
 
 
87 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.66583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1483  transposase IS3/IS911  48.81 
 
 
87 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2820  transposase IS3/IS911  48.81 
 
 
87 aa  94.7  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 
88 aa  95.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  94.4  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0079  IS407A, transposase OrfA  70.49 
 
 
85 aa  92.8  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0747988  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1303  transposase IS3/IS911  48.84 
 
 
87 aa  92.8  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  48.86 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0065  transposase  47.67 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  48.86 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  48.86 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  92  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2513  hypothetical protein  55.26 
 
 
87 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4650  transposase IS3/IS911 family protein  50.59 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204613  normal  0.663628 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  46.59 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  55.56 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2424  transposase IS3/IS911  47.62 
 
 
89 aa  90.5  8e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0308249  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55070  hypothetical protein  53.95 
 
 
87 aa  90.1  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760769  unclonable  1.2837699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  90.5  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  50 
 
 
88 aa  89.7  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>