More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_1303 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_1303  transposase IS3/IS911  100 
 
 		 87 aa  173  9e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  81.61 
 
 		 87 aa  153  7e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  151  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03931  ISXoo3 transposase ORF A  80.46 
 
 		 87 aa  150  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 89 aa  151  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02742  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  150  7e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01543  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  150  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03279  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  150  8e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  79.31 
 
 		 87 aa  149  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05777  IS66 family element, Orf1 protein, putative  81.18 
 
 		 130 aa  147  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02572  ISXoo3 transposase ORF A  78.16 
 
 		 87 aa  148  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00699  ISXoo3 transposase ORF A  78.16 
 
 		 87 aa  147  4e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.722368  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05705  IS66 family element, Orf1 protein, putative  80 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  77.01 
 
 		 94 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_05448  IS66 family element, Orf1 protein, putative  80 
 
 		 132 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01847  ISXoo3 transposase ORF A  75.86 
 
 		 87 aa  141  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00733  ISXoo3 transposase ORF A  74.71 
 
 		 87 aa  139  9.999999999999999e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.632104  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2424  transposase IS3/IS911  70.93 
 
 		 89 aa  131  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0308249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4647  transposase IS3/IS911 family protein  69.77 
 
 		 87 aa  131  3e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3030  transposase  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.339863  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1425  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.565113  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0643  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.909976  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4720  transposase IS3/IS911 family protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1596  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2224  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0160  transposase  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3352  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2134  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.692115  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0182  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.237707  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1450  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.23699  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0922  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0437514  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0027  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2697  transposase  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0297  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000529534  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0313  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00217618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0782  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1720  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0359558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0089  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0511092  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1167  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1074  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.721827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0022  transposase  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2048  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0705823  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1552  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2798  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1913  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000126039  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1567  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.996412  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0122  hypothetical protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3021  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1750  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.834954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1648  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  130  6.999999999999999e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.699645  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2146  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  69.77 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0137  transposase IS3/IS911  65.12 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1300  transposase IS3/IS911  65.12 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.66583  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1483  transposase IS3/IS911  65.12 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2820  transposase IS3/IS911  65.12 
 
 		 87 aa  129  1.0000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0285  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0585  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.843221  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0720  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0609624  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1118  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.0000000201818  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1204  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.234907  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1295  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1842  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.987481  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0275  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.11388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0414  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.051862  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0437  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.470648  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0498  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0551  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0588539  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0556  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0856086  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0583  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.140612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0648  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.293699  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1174  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.174757  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1504  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1513  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.018385  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1645  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1759  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1788  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1946  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.427252  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2074  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1750  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0455865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0579  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000590695  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0618  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.469704  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0686  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.141175  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0710  IS407A, transposase OrfA  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0822  transposase subfamily protein  68.6 
 
 		 87 aa  128  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>