More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3443 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 
88 aa  177  4.999999999999999e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  93.18 
 
 
88 aa  167  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  90.91 
 
 
88 aa  163  8e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  70.11 
 
 
88 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  70.11 
 
 
88 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  70.11 
 
 
88 aa  135  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  70.11 
 
 
88 aa  133  9e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  69.77 
 
 
88 aa  130  5e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  69.77 
 
 
88 aa  129  1.0000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  128  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  67.82 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  63.22 
 
 
88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  59.77 
 
 
88 aa  121  3e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  62.07 
 
 
88 aa  121  4e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  58.62 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  58.62 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  59.77 
 
 
88 aa  118  3e-26  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  65.52 
 
 
88 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  65.52 
 
 
88 aa  118  3e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  60.92 
 
 
362 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  60.92 
 
 
362 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  60.92 
 
 
362 aa  117  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  55.68 
 
 
492 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  77.94 
 
 
362 aa  111  3e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  55.17 
 
 
93 aa  110  9e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  76.47 
 
 
362 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  76.47 
 
 
362 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0079  IS407A, transposase OrfA  82.46 
 
 
85 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0747988  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  53.66 
 
 
399 aa  102  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  52.87 
 
 
87 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
96 aa  99.8  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  57.47 
 
 
88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  57.47 
 
 
88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  57.47 
 
 
88 aa  99  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  98.2  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  54.65 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  51.72 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  51.72 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0065  transposase  54.02 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  54.65 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  54.65 
 
 
88 aa  98.2  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
88 aa  97.4  5e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  97.1  8e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
86 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
86 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
86 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  54.02 
 
 
372 aa  94.7  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
86 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  51.22 
 
 
86 aa  94.4  4e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
370 aa  94  6e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  93.6  9e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  53.85 
 
 
88 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  47.13 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  47.13 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  47.13 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  90.9  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  49.43 
 
 
88 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1303  transposase IS3/IS911  51.76 
 
 
87 aa  90.5  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  49.43 
 
 
88 aa  90.5  7e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  58.57 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1493  ISRSO14-transposase ORFA protein  58.57 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.504029  normal  0.961053 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2406  ISRSO14-transposase ORFA protein  58.57 
 
 
87 aa  90.5  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>