More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0079 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007650  BTH_II0079  IS407A, transposase OrfA  100 
 
 
85 aa  173  8e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0747988  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  82.46 
 
 
88 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  66.67 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  75.44 
 
 
88 aa  97.1  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  72.13 
 
 
88 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2689  prophage LambdaMc01, ISMca4, transposase, OrfAB  73.68 
 
 
362 aa  94.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0539833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  71.93 
 
 
88 aa  94.4  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0823  ISMca4, transposase, OrfAB  73.68 
 
 
362 aa  92.8  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.586582  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  70.49 
 
 
88 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  73.68 
 
 
88 aa  92.4  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  71.93 
 
 
492 aa  92  2e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  71.93 
 
 
87 aa  91.7  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1620  ISMca4, transposase, OrfAB  71.93 
 
 
362 aa  91.3  4e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  71.93 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  71.93 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  71.93 
 
 
88 aa  91.3  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  71.93 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  71.93 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  71.93 
 
 
88 aa  88.6  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  70.18 
 
 
88 aa  87.8  4e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  70.18 
 
 
93 aa  87  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  68.42 
 
 
362 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  68.42 
 
 
362 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  68.42 
 
 
362 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  59.65 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  59.65 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  59.65 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  69.23 
 
 
399 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  61.4 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  51.43 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  52.17 
 
 
87 aa  80.9  0.000000000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  61.4 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  80.5  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  50.65 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  50.65 
 
 
88 aa  80.1  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  45.88 
 
 
88 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  56.14 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  50 
 
 
88 aa  78.6  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  52.86 
 
 
88 aa  78.2  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
96 aa  77.8  0.00000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  48.1 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
88 aa  77.4  0.00000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
370 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  48.57 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  48.57 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  48.57 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  48.57 
 
 
88 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1457  transposase IS3/IS911 family protein  48.05 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080676  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  47.14 
 
 
99 aa  75.1  0.0000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  48.57 
 
 
88 aa  75.5  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  50 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  57.89 
 
 
88 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  51.43 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  47.83 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  51.43 
 
 
88 aa  74.7  0.0000000000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  56.14 
 
 
88 aa  74.3  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0744  integrase catalytic subunit  54.39 
 
 
393 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3956  transposase IS3/IS911 family protein  67.31 
 
 
63 aa  74.3  0.0000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  45.45 
 
 
92 aa  73.9  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0898  transposase IS3 protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.567921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1258  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.542288  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0936  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.582923  normal  0.33404 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0649  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.343729 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1768  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.383553  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1719  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.662695  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1761  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1688  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2430  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.755967  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2654  transposase IS3 family protein  49.32 
 
 
372 aa  73.9  0.0000000000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0683836  normal  0.423018 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0829  ISRSO14-transposase ORFA protein  50 
 
 
87 aa  73.9  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>