More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_3395 on replicon NC_009429
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  100 
 
 
93 aa  190  4e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  95.65 
 
 
492 aa  181  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  95.4 
 
 
87 aa  170  5e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  95.06 
 
 
399 aa  159  1e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  75.86 
 
 
362 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  75.86 
 
 
362 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  75.86 
 
 
362 aa  149  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  65.52 
 
 
88 aa  133  9e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  63.22 
 
 
88 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3471  hypothetical protein  95.24 
 
 
338 aa  125  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.139394 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  62.07 
 
 
88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  62.07 
 
 
88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  62.07 
 
 
88 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  65.12 
 
 
88 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  59.77 
 
 
88 aa  123  9e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  61.63 
 
 
88 aa  120  8e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
96 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
96 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
96 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
96 aa  117  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
370 aa  115  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  52.87 
 
 
88 aa  112  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  110  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  110  6e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  50.57 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  50.57 
 
 
88 aa  110  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  50.57 
 
 
88 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  110  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  108  3e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  51.72 
 
 
87 aa  107  7.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  54.02 
 
 
88 aa  107  7.000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  106  1e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  55.95 
 
 
88 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  55.95 
 
 
88 aa  105  2e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  52.87 
 
 
88 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  52.87 
 
 
88 aa  105  3e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  105  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  56.32 
 
 
88 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1505  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
86 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1493  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
86 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.363102 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1473  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
86 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.679984  normal  0.0616512 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1943  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
86 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1117  transposase IS3/IS911 family protein  54.88 
 
 
86 aa  104  5e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3081  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  103  8e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4892  transposase family protein  53.49 
 
 
92 aa  103  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0142849 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1972  hypothetical protein  50.57 
 
 
88 aa  103  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.806101 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 
87 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  52.87 
 
 
88 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  102  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  51.76 
 
 
87 aa  102  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  52.87 
 
 
88 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  51.76 
 
 
87 aa  102  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 
88 aa  102  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
88 aa  101  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2300  transposase IS3/IS911 family protein  52.33 
 
 
94 aa  101  4e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356728  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  100  6e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  52.87 
 
 
88 aa  100  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  100  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7057  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 
88 aa  100  7e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  100  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  51.16 
 
 
88 aa  99.4  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4321  transposase IS3/IS911 family protein  51.72 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.583527  normal  0.389304 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7038  transposase IS3/IS911 family protein  49.43 
 
 
88 aa  98.6  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3341  hypothetical protein  50.57 
 
 
88 aa  99  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  99.4  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  48.84 
 
 
88 aa  98.6  3e-20  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0065  transposase  49.43 
 
 
88 aa  97.8  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0857  hypothetical protein  49.43 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  48.28 
 
 
88 aa  97.8  5e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>