More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyc_0639 on replicon NC_007204
Organism: Psychrobacter arcticus 273-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  100 
 
 
88 aa  184  4e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  95.45 
 
 
88 aa  179  1e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  89.77 
 
 
88 aa  170  6.999999999999999e-42  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  82.95 
 
 
88 aa  159  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  69.32 
 
 
88 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  69.32 
 
 
88 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  69.32 
 
 
88 aa  142  1e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  71.59 
 
 
88 aa  141  4e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  69.32 
 
 
88 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  69.32 
 
 
88 aa  138  3e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  65.91 
 
 
88 aa  134  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4052  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0401  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 
88 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  60.23 
 
 
88 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  57.95 
 
 
88 aa  124  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3443  transposase IS3/IS911 family protein  58.62 
 
 
88 aa  119  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.619662 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
362 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
362 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  59.77 
 
 
362 aa  117  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
370 aa  114  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6662  transposase IS3/IS911 family protein  56.32 
 
 
88 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00105508  hitchhiker  0.00193087 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  50.57 
 
 
87 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  51.16 
 
 
492 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  55.17 
 
 
96 aa  110  5e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  50.57 
 
 
93 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0356  IS407A, transposase OrfA  56.32 
 
 
88 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1235  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2193  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1288  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  105  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
87 aa  105  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2355  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0275  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0431  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2228  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  50 
 
 
88 aa  103  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  54.65 
 
 
87 aa  103  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  51.14 
 
 
88 aa  103  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2601  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  103  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  54.02 
 
 
88 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1263  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  54.02 
 
 
88 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0943  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  102  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  54.65 
 
 
87 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  48.28 
 
 
87 aa  102  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04016  ISXoo3 transposase ORF A  50 
 
 
87 aa  102  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  48.86 
 
 
88 aa  102  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  102  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06245  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.311996  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01074  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  101  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.270456  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1137  transposase IS3/IS911 family protein  54.02 
 
 
88 aa  100  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0964604  hitchhiker  0.000000141669 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00713  transposase  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0015797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02483  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01959  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0236899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02528  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01538  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.297821  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02901  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03998  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04438  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
89 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04193  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1413  integrase catalytic subunit  48.75 
 
 
399 aa  100  6e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04490  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02393  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  6e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.567997  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1303  transposase IS3/IS911  51.16 
 
 
87 aa  100  8e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.705881  normal  0.106093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4596  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 
88 aa  100  8e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0317  transposase  51.76 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00457951  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02555  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.104602  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03602  ISXoo3 transposase ORF A  47.67 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.485987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  52.87 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03025  ISXoo3 transposase ORF A  47.67 
 
 
87 aa  99.8  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.752388  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2896  transposase  51.76 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000661086  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  99.8  1e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02942  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0664687  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2982  transposase IS3/IS911 family protein  51.76 
 
 
87 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.439575  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03197  ISXoo3 transposase ORF A  48.84 
 
 
87 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.818728  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04312  transposase  47.67 
 
 
94 aa  100  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
88 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.882739 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2308  transposase IS3/IS911 family protein  52.27 
 
 
88 aa  99  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  47.73 
 
 
88 aa  99  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3813  transposase A  50 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.633568  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3882  transposase A  50 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0091  transposase A  50 
 
 
96 aa  98.6  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.582456  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03279  ISXoo3 transposase ORF A  47.67 
 
 
87 aa  98.6  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.351629  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>