More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0548 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0548  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0088  hypothetical protein  100 
 
 		 50 aa  104  5e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00165829  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2241  transposase  75 
 
 		 49 aa  77.4  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.164998 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2060  transposase  75 
 
 		 49 aa  76.6  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125983  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  78.05 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  78.05 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  78.05 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  73.17 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  73.17 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  75.61 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  75.61 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  75.61 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  75.61 
 
 		 88 aa  69.3  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  78.05 
 
 		 88 aa  68.9  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0644  hypothetical protein  70.83 
 
 		 49 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  73.17 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  75.61 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  75.61 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  75.61 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  75.61 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  76.92 
 
 		 359 aa  67  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 		 88 aa  67  0.00000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0659  transposase IS3/IS911 family protein  73.17 
 
 		 59 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.335609  normal  0.0301551 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5733  hypothetical protein  79.49 
 
 		 72 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115399  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  60.98 
 
 		 85 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  63.41 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1637  hypothetical protein  68.29 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  60.98 
 
 		 99 aa  61.2  0.000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1624  remnant of A ISRSO16-transposase ORFA protein  65.96 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1629  C-terminus of TISRSO16 ORFA transposase protein  65.96 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2634  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.492474  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0442  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.317076  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  60 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2882  hypothetical protein  67.39 
 
 		 99 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.663087  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4740  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2927  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0959  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6104  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  56 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  63.41 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  63.41 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  63.41 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  63.41 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0079  IS407A, transposase OrfA  63.41 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0747988  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2730  isrso12-transposase orfa  77.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1114  ISRSO16-transposase OrfA protein  77.14 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  62 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4528  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4335  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.983933  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  63.41 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  63.41 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  63.41 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  66.67 
 
 		 93 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0466  transposase IS3/IS911 family protein  56.1 
 
 		 88 aa  57  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  61.54 
 
 		 370 aa  56.6  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3628  transposase IS3/IS911 family protein  65.85 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00241648  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2513  hypothetical protein  61.54 
 
 		 87 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  65.85 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 96 aa  55.8  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6020  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.02017 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1065  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0220  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0746884 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1609  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0629133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3471  transposase IS3/IS911 family protein  53.66 
 
 		 88 aa  55.1  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0959135  normal  0.645144 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55070  hypothetical protein  58.97 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000760769  unclonable  1.2837699999999998e-21 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4090  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.702583  normal  0.16367 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3356  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  60.98 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2510  transposase  60.98 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.021123 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0403  insertion element ISR1 uncharacterized 10 kDa protein A3  60.98 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.868889 
 
 
-
 
NC_002936  DET0165  ISDet2, transposase orfA  56.1 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.265769  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1443  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1571  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2011  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2056  transposase IS3/IS911  58.54 
 
 		 92 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0286844  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  60.98 
 
 		 87 aa  54.7  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  64.1 
 
 		 492 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0641  transposase subfamily protein  61.54 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  58.54 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  58.54 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03180  hypothetical protein  58.97 
 
 		 87 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000135  hitchhiker  0.00000000259634 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  58.54 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>