More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0659 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0659  transposase IS3/IS911 family protein  100 
 
 		 59 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.335609  normal  0.0301551 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1495  transposase IS3/IS911 family protein  68.63 
 
 		 88 aa  82.4  0.000000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0557  ISRSO16-transposase OrfA protein  68.63 
 
 		 88 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.235174 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3127  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.800536  normal  0.701441 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3534  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.545436  normal  0.522486 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2969  transposase IS3/IS911  66.67 
 
 		 88 aa  79.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0895571 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2285  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0445809  normal  0.0110111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2278  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00023086  normal  0.050685 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6172  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0125  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.405857 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3837  transposase IS3/IS911 family protein  66.67 
 
 		 88 aa  78.6  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7700  IS3 family transposase  77.27 
 
 		 359 aa  77.8  0.00000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.421259  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2906  Fis family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000119814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1433  transposase IS3/IS911 family protein  68.75 
 
 		 88 aa  77  0.00000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2756  transposase IS3/IS911 family protein  62.75 
 
 		 88 aa  76.6  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3246  transposase IS3/IS911  64.71 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00639582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0093  transposase  64.58 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.426296 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3926  transposase IS3/IS911 family protein  64.58 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00287084  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0132  isrso12-transposase orfa protein  64.58 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.183288  normal  0.0817579 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1111  transposase IS3/IS911 family protein  62.75 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.207112 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5527  transposase IS3/IS911 family protein  62.75 
 
 		 88 aa  74.7  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100543 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0066  transposase IS3/IS911 family protein  64.58 
 
 		 88 aa  74.3  0.0000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7752  putative insertion element ISR1-like protein  60 
 
 		 88 aa  73.2  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.619622  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1438  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2707  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0503  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1299  isrso12-transposase orfa protein  66.67 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1803  transposase IS3/IS911 family protein  64.58 
 
 		 87 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0637  transposase IS3/IS911  52.94 
 
 		 88 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0643  putative transposase  60.42 
 
 		 99 aa  70.5  0.000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.6553  normal  0.737994 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3395  hypothetical protein  63.27 
 
 		 93 aa  70.1  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.521621  normal  0.861673 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0636  IS3 family transposase  56.25 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.375793 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0639  IS3 family transposase  56.25 
 
 		 88 aa  69.7  0.00000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.388667 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2313  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0881  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0140867  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3122  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.956375  normal  0.520056 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1548  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 88 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0527  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 96 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.781347  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 370 aa  69.3  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0850  IS3 family transposase  54.17 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.727621 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3765  hypothetical protein  64.58 
 
 		 492 aa  68.6  0.00000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0720  transposase subfamily  58.82 
 
 		 88 aa  68.6  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.116485 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1184  transposase IS3/IS911  54.17 
 
 		 85 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04442  isrso16-transposase orfa protein  58 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0966  ISSod2, transposase OrfA  58.33 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2161  ISSod2, transposase OrfA  58.33 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4268  ISSod2, transposase OrfA  58.33 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3069  transposase family protein  50.98 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3365  ISSod2, transposase OrfA  54.17 
 
 		 88 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4807  transposase subfamily  50.98 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.650973  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0026  transposase subfamily  60.87 
 
 		 87 aa  66.6  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.138106  normal  0.472585 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4024  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 88 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0548  hypothetical protein  73.17 
 
 		 50 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2711  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.155615  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0657  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2735  transposase IS3/IS911 family protein  60.42 
 
 		 362 aa  66.6  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0088  hypothetical protein  73.17 
 
 		 50 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00165829  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4079  transposase IS3/IS911 family protein  60.87 
 
 		 87 aa  66.2  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0199  hypothetical protein  54.17 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1078  hypothetical protein  54.17 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02903  transposase ORF-A, IS-type  54.17 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1779  IS3 family transposase  52.08 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6507  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2856  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000104071  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3450  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000413069  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3961  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 88 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6241  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.328617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2861  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5715  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 88 aa  65.5  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2975  transposase family protein  56.25 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.385595  normal  0.0860166 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4608  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.546764  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3761  ISSod2, transposase OrfA  54.17 
 
 		 88 aa  64.3  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0673  transposase IS3 family protein  52.08 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.112042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4982  transposase IS3 family protein  52.08 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4558  transposase IS3 family protein  52.08 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.289218 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2942  transposase subfamily protein  49.02 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.342551  hitchhiker  1.76227e-24 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0595  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3628  transposase IS3/IS911 family protein  52.94 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00241648  normal  0.128538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0036  transposase IS3/IS911 family protein  56.25 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2579  transposase IS3/IS911 family protein  54.17 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0712611  unclonable  0.0000116597 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0463  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2507  transposase  58.33 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0154773 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2103  putative transposase  58.33 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0726746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1914  putative insertion element / transposase  58.33 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.863357  hitchhiker  0.0000000229131 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0875  transposase IS3/IS911 family protein  58.33 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.572302 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1114  ISRSO16-transposase OrfA protein  57.45 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2899  ISSod2, transposase OrfA  52.08 
 
 		 88 aa  63.5  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1637  hypothetical protein  57.78 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2730  isrso12-transposase orfa  57.45 
 
 		 103 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0375  transposase IS3/IS911 family protein  58.7 
 
 		 87 aa  63.2  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000436145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0240  transposase IS3/IS911 family protein  50 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0945399 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4892  transposase IS3/IS911 family protein  52.08 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.050362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2820  transposase IS3/IS911  55.32 
 
 		 87 aa  62.8  0.000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2311  transposase IS3/IS911 family protein  51.02 
 
 		 88 aa  62.4  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.882739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>