29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc1400 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  100 
 
 		 375 aa  760    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  73.8 
 
 		 373 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  73.87 
 
 		 373 aa  559  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  41.55 
 
 		 342 aa  203  5e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  40.26 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  37.99 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  38.83 
 
 		 339 aa  198  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  38.59 
 
 		 322 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  38.59 
 
 		 322 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  40 
 
 		 337 aa  189  7e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  35.59 
 
 		 386 aa  186  5e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  38.34 
 
 		 414 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  38.34 
 
 		 389 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  37.82 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  39.49 
 
 		 338 aa  182  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  39.16 
 
 		 329 aa  176  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  36.97 
 
 		 317 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  38.52 
 
 		 329 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  37.36 
 
 		 300 aa  135  8e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  33.65 
 
 		 409 aa  120  4.9999999999999996e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  30.42 
 
 		 347 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  34.44 
 
 		 381 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  33.22 
 
 		 358 aa  114  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.46 
 
 		 515 aa  109  9.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  32.67 
 
 		 286 aa  107  4e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  30.39 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  24.66 
 
 		 478 aa  70.5  0.00000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  25.75 
 
 		 392 aa  62.4  0.00000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  29.63 
 
 		 313 aa  49.7  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>