31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2742 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  100 
 
 
300 aa  584  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  42.02 
 
 
342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  36.3 
 
 
317 aa  177  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  38.35 
 
 
322 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  39.19 
 
 
386 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  38.35 
 
 
322 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  39.27 
 
 
389 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  39.27 
 
 
414 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  38.55 
 
 
389 aa  169  4e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  40.28 
 
 
337 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  36.26 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  35.88 
 
 
329 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  36.21 
 
 
339 aa  160  3e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  38.67 
 
 
338 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  35.51 
 
 
358 aa  150  3e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  35.14 
 
 
358 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  36.79 
 
 
375 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  34.52 
 
 
373 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  34.16 
 
 
373 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  31.73 
 
 
347 aa  102  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  27.67 
 
 
358 aa  88.6  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  28.62 
 
 
409 aa  87.4  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  28.44 
 
 
286 aa  79  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  25.8 
 
 
515 aa  77.8  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  27.04 
 
 
381 aa  69.7  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  23.1 
 
 
478 aa  65.9  0.0000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  31.71 
 
 
225 aa  63.2  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  25.65 
 
 
392 aa  59.7  0.00000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  29.64 
 
 
313 aa  57.4  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1555  hypothetical protein  26.17 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1713  hypothetical protein  30.61 
 
 
318 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.717122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>