28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6615 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  100 
 
 
338 aa  684    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  86.14 
 
 
337 aa  578  1e-164  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  49.54 
 
 
358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  48.92 
 
 
358 aa  301  9e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  50.76 
 
 
342 aa  299  4e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  50.91 
 
 
339 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  50.88 
 
 
317 aa  287  2e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  46.5 
 
 
389 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  48.11 
 
 
329 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  47.77 
 
 
329 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  46.2 
 
 
414 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  46.2 
 
 
389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  44.82 
 
 
386 aa  265  8e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  46.1 
 
 
322 aa  258  8e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  45.78 
 
 
322 aa  257  2e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  40.13 
 
 
375 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  36.11 
 
 
373 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  37.05 
 
 
373 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  40.98 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  36.66 
 
 
347 aa  134  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  33.74 
 
 
381 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  33.65 
 
 
409 aa  129  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  31.46 
 
 
515 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  32.79 
 
 
358 aa  119  6e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  31.58 
 
 
286 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.79 
 
 
478 aa  76.6  0.0000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  26.74 
 
 
392 aa  74.3  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>