25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4221 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  760    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  54.26 
 
 		 347 aa  352  8.999999999999999e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  47.53 
 
 		 358 aa  298  1e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  33.23 
 
 		 322 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  32.91 
 
 		 322 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  30.32 
 
 		 329 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  34.85 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  29.81 
 
 		 329 aa  139  6e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  34.63 
 
 		 358 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  32.9 
 
 		 414 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  32.9 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  33.55 
 
 		 389 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  32.57 
 
 		 317 aa  138  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  34.59 
 
 		 358 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  33.82 
 
 		 339 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  33.53 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  32.61 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  32.92 
 
 		 337 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  34.22 
 
 		 375 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  28.91 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  29.57 
 
 		 373 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  26.06 
 
 		 409 aa  77.8  0.0000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  27.03 
 
 		 300 aa  77  0.0000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  30.48 
 
 		 225 aa  61.6  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  23.3 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>