29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A2738 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  98.76 
 
 
322 aa  654    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  100 
 
 
322 aa  661    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  76.97 
 
 
414 aa  521  1e-147  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  77.6 
 
 
389 aa  518  1e-146  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  76.97 
 
 
389 aa  520  1e-146  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  75.24 
 
 
386 aa  511  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  45.31 
 
 
358 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  49.14 
 
 
339 aa  277  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  46.03 
 
 
358 aa  277  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  47.84 
 
 
329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  46.4 
 
 
329 aa  263  4e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  46.43 
 
 
317 aa  259  4e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  46.1 
 
 
337 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  45.78 
 
 
338 aa  250  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  41.72 
 
 
342 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  37.37 
 
 
373 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  37.12 
 
 
373 aa  193  4e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  38.59 
 
 
375 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  39 
 
 
300 aa  171  1e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  49.11 
 
 
225 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  35.78 
 
 
347 aa  155  8e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  33.23 
 
 
381 aa  143  3e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  30.34 
 
 
515 aa  134  1.9999999999999998e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  31.83 
 
 
358 aa  127  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  31.07 
 
 
409 aa  114  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  27.27 
 
 
286 aa  94.4  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 
478 aa  92.4  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  27.18 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  23.6 
 
 
313 aa  43.9  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>