30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_6617 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  93.02 
 
 
358 aa  690    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  733    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  53.25 
 
 
339 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  46.67 
 
 
389 aa  306  3e-82  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  48.12 
 
 
386 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  45.8 
 
 
414 aa  302  6.000000000000001e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  45.8 
 
 
389 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  45.51 
 
 
329 aa  296  3e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  48.6 
 
 
337 aa  295  8e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  45.51 
 
 
329 aa  294  1e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  50.54 
 
 
317 aa  288  8e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  47.99 
 
 
338 aa  287  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  46.03 
 
 
322 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  46.03 
 
 
322 aa  277  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  42.22 
 
 
342 aa  258  1e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  38.38 
 
 
373 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  39.74 
 
 
373 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  40.26 
 
 
375 aa  202  5e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  36.4 
 
 
300 aa  144  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  37.8 
 
 
347 aa  139  7e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  34.59 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.38 
 
 
515 aa  126  7e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  37.63 
 
 
225 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  31.4 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  33.45 
 
 
409 aa  107  3e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  28.52 
 
 
286 aa  89  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
478 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  25.14 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  42.11 
 
 
313 aa  47.4  0.0004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1713  hypothetical protein  30.41 
 
 
318 aa  46.2  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.717122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>