30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2606 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  100 
 
 
358 aa  733    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  93.02 
 
 
358 aa  690    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  52.52 
 
 
339 aa  325  9e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  46.96 
 
 
389 aa  308  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  46.85 
 
 
329 aa  306  3e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  46.85 
 
 
329 aa  305  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  46.09 
 
 
414 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  46.09 
 
 
389 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  48.4 
 
 
386 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  47.45 
 
 
337 aa  297  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  51.25 
 
 
317 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  48.61 
 
 
338 aa  288  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  45.31 
 
 
322 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  45.31 
 
 
322 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  41.9 
 
 
342 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  38.7 
 
 
373 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  40.13 
 
 
373 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  40.33 
 
 
375 aa  199  5e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  36.78 
 
 
300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  37.8 
 
 
347 aa  142  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  34.63 
 
 
381 aa  130  2.0000000000000002e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  30.25 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  38.29 
 
 
225 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  32.48 
 
 
358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  32.18 
 
 
409 aa  108  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  29.92 
 
 
286 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 
478 aa  78.6  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  23.12 
 
 
392 aa  70.1  0.00000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  26.73 
 
 
313 aa  48.9  0.0001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1713  hypothetical protein  30.41 
 
 
318 aa  44.7  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.717122 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>