28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2604 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  682    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  86.14 
 
 		 338 aa  569  1e-161  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  47.45 
 
 		 358 aa  305  9.000000000000001e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  48.6 
 
 		 358 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  52.13 
 
 		 339 aa  301  7.000000000000001e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  50.15 
 
 		 342 aa  293  4e-78  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  50.18 
 
 		 317 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  46.08 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  49.14 
 
 		 329 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  48.8 
 
 		 329 aa  272  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  46.39 
 
 		 414 aa  271  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  46.39 
 
 		 389 aa  271  9e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  45.32 
 
 		 386 aa  269  4e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  46.1 
 
 		 322 aa  255  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  45.78 
 
 		 322 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  40 
 
 		 375 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  37.46 
 
 		 373 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  36.22 
 
 		 373 aa  186  6e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  40.98 
 
 		 300 aa  166  5.9999999999999996e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  36.01 
 
 		 347 aa  130  3e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  35.14 
 
 		 409 aa  129  7.000000000000001e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  31.04 
 
 		 358 aa  121  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  32.7 
 
 		 381 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.91 
 
 		 515 aa  120  3e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  37.5 
 
 		 225 aa  110  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  31.7 
 
 		 286 aa  93.6  5e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  26.69 
 
 		 392 aa  86.7  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.33 
 
 		 478 aa  81.6  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29692 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>