29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3606 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  782    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  98.2 
 
 		 389 aa  772    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  100 
 
 		 414 aa  827    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  85.86 
 
 		 386 aa  678    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  77.29 
 
 		 322 aa  523  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  76.97 
 
 		 322 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  46.09 
 
 		 358 aa  304  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  45.8 
 
 		 358 aa  302  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  48.52 
 
 		 339 aa  281  1e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  50.91 
 
 		 317 aa  276  4e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  45.13 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  44.81 
 
 		 329 aa  270  4e-71  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  46.39 
 
 		 337 aa  267  2e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  45.9 
 
 		 338 aa  265  1e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  44.34 
 
 		 342 aa  256  7e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  35.03 
 
 		 373 aa  199  1.0000000000000001e-49  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  35.33 
 
 		 373 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  52.6 
 
 		 225 aa  192  1e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  38.34 
 
 		 375 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  40.78 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  38.54 
 
 		 347 aa  151  2e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  32.9 
 
 		 381 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.85 
 
 		 515 aa  130  3e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  32.45 
 
 		 358 aa  122  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  32 
 
 		 409 aa  115  1.0000000000000001e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  27.78 
 
 		 478 aa  92.8  9e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  28.79 
 
 		 286 aa  89.7  8e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  28.67 
 
 		 392 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  26.42 
 
 		 313 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>