29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7522 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  683    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  52.52 
 
 
358 aa  335  5e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  53.25 
 
 
358 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  51.52 
 
 
337 aa  306  3e-82  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  49.11 
 
 
389 aa  301  1e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  48.52 
 
 
414 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  48.52 
 
 
389 aa  296  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  50.61 
 
 
338 aa  293  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  50.97 
 
 
386 aa  292  7e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  46.83 
 
 
329 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  49.14 
 
 
322 aa  286  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  48.8 
 
 
322 aa  285  8e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  49.12 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  50.92 
 
 
317 aa  278  1e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  46.35 
 
 
342 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  37.92 
 
 
373 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  37.08 
 
 
373 aa  199  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  39.62 
 
 
375 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  37.76 
 
 
300 aa  160  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  46.5 
 
 
225 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  36.16 
 
 
381 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  39.43 
 
 
347 aa  124  2e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  33.55 
 
 
409 aa  122  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  30.65 
 
 
515 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  32.52 
 
 
358 aa  107  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  28.34 
 
 
392 aa  100  3e-20  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  29.28 
 
 
286 aa  87  4e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.23 
 
 
478 aa  85.5  0.000000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1314  hypothetical protein  26.78 
 
 
281 aa  48.1  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576469  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>