31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4290 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  97.26 
 
 		 329 aa  668    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  683    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  55.79 
 
 		 317 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  46.85 
 
 		 358 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  45.51 
 
 		 358 aa  294  1e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  45.92 
 
 		 339 aa  277  1e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  44.81 
 
 		 389 aa  273  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  44.16 
 
 		 386 aa  271  1e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  44.81 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  44.81 
 
 		 414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  48.8 
 
 		 337 aa  266  4e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  46.4 
 
 		 322 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  46.04 
 
 		 322 aa  261  1e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  47.08 
 
 		 338 aa  260  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  44.37 
 
 		 342 aa  258  8e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  38.52 
 
 		 375 aa  172  5e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  37.46 
 
 		 373 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  36.88 
 
 		 373 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  36.86 
 
 		 300 aa  161  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  34.4 
 
 		 347 aa  155  7e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  33.55 
 
 		 358 aa  140  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  32.07 
 
 		 409 aa  135  7.000000000000001e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  29.68 
 
 		 381 aa  133  3.9999999999999996e-30  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.41 
 
 		 515 aa  109  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  27.33 
 
 		 478 aa  93.6  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  35.59 
 
 		 225 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  27.63 
 
 		 392 aa  89  9e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  27.71 
 
 		 286 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  26.72 
 
 		 313 aa  56.6  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1555  hypothetical protein  26.32 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1314  hypothetical protein  23.31 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>