31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_4914 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_4914  hypothetical protein  100 
 
 		 317 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000636014  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4658  hypothetical protein  55.49 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4290  hypothetical protein  55.79 
 
 		 329 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2606  hypothetical protein  51.25 
 
 		 358 aa  293  3e-78  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.410874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6617  hypothetical protein  50.54 
 
 		 358 aa  288  7e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.241145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5522  hypothetical protein  50.91 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.810639 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0964  hypothetical protein  48.94 
 
 		 386 aa  277  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3606  hypothetical protein  50.91 
 
 		 414 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4761  hypothetical protein  50.91 
 
 		 389 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2604  hypothetical protein  50.18 
 
 		 337 aa  274  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.711054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6615  hypothetical protein  50.18 
 
 		 338 aa  272  5.000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0334061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7522  hypothetical protein  50.55 
 
 		 339 aa  269  4e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.133006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2890  hypothetical protein  46.43 
 
 		 322 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2738  hypothetical protein  46.43 
 
 		 322 aa  259  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3536  hypothetical protein  43.86 
 
 		 342 aa  242  6e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.30989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1274  putative transmembrane protein  38.16 
 
 		 373 aa  185  9e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.12139 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1338  putative transmembrane protein  38.03 
 
 		 373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.23156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2742  hypothetical protein  37.97 
 
 		 300 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0552667  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1400  putative transmembrane protein  36.97 
 
 		 375 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45633  predicted protein  32.45 
 
 		 409 aa  141  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.75822  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2610  hypothetical protein  32.35 
 
 		 358 aa  135  9e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639854  normal  0.625202 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3037  hypothetical protein  34.47 
 
 		 347 aa  132  6e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.378561  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4221  hypothetical protein  32.57 
 
 		 381 aa  129  6e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0716208  normal  0.290743 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_36381  predicted protein  29.6 
 
 		 515 aa  100  5e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03262  conserved hypothetical protein  29.01 
 
 		 392 aa  97.4  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.984103  normal  0.141764 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6637  hypothetical protein  36.03 
 
 		 225 aa  96.7  5e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.289051  normal  1 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_33738  predicted protein  31.11 
 
 		 286 aa  96.3  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0455697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05033  conserved hypothetical protein  26.77 
 
 		 478 aa  96.3  7e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.29692 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0980  hypothetical protein  27.08 
 
 		 313 aa  62.8  0.000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1555  hypothetical protein  23.62 
 
 		 303 aa  50.8  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1314  hypothetical protein  27.61 
 
 		 281 aa  46.6  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.576469  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>