50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3543 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3543  type I restriction-modification system restriction subunit  100 
 
 		 366 aa  740    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1553  protein of unknown function DUF450  48.68 
 
 		 985 aa  256  6e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0797  protein of unknown function DUF450  27.47 
 
 		 1000 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00985204 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0278  hypothetical protein  30.36 
 
 		 989 aa  96.7  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2685  DEAD/DEAH box helicase  29.21 
 
 		 1009 aa  93.6  5e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0659  protein of unknown function DUF450  28.12 
 
 		 969 aa  90.9  3e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4250  protein of unknown function DUF450  30.9 
 
 		 1027 aa  87.8  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1789  type III restriction enzyme, res subunit  30.73 
 
 		 1029 aa  87.4  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2695  hypothetical protein  24.63 
 
 		 1008 aa  86.7  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.285383  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4924  hypothetical protein  25.27 
 
 		 1035 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2197  protein of unknown function DUF450  24.24 
 
 		 999 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1859  DEAD/DEAH box helicase-like  24.33 
 
 		 997 aa  80.1  0.00000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.397249  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0749  type III restriction protein res subunit  26.82 
 
 		 992 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186322 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3355  hypothetical protein  31.8 
 
 		 1007 aa  78.6  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.18974  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3992  type III restriction protein res subunit  26.92 
 
 		 984 aa  77.4  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.208178 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19090  helicase, type I site-specific restriction-modification system restriction subunit  27.39 
 
 		 1004 aa  75.1  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.210967 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1014  type I restriction-modification system restriction subunit  27.84 
 
 		 965 aa  74.3  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1151  hypothetical protein  29.21 
 
 		 1059 aa  72  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.255903  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0780  type I site-specific deoxyribonuclease chain R  28.5 
 
 		 971 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0180253  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2607  hypothetical protein  29.77 
 
 		 1022 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1325  type III restriction enzyme, res subunit  26.09 
 
 		 1112 aa  69.3  0.00000000009  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1218  hypothetical protein  22.62 
 
 		 990 aa  67.4  0.0000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0958  protein of unknown function DUF450  29.82 
 
 		 1067 aa  67  0.0000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0598  type I site-specific restriction-modification system, R subunit  25.5 
 
 		 1052 aa  64.3  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1859  hypothetical protein  25.85 
 
 		 1033 aa  63.9  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1482  hypothetical protein  23.81 
 
 		 1081 aa  62.4  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4471  hypothetical protein  24.49 
 
 		 991 aa  61.6  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.756132  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0415  hypothetical protein  32.58 
 
 		 1069 aa  61.2  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.484825  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0230  hypothetical protein  26 
 
 		 1060 aa  61.6  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0485  hypothetical protein  25.38 
 
 		 1039 aa  61.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.646894  decreased coverage  0.000377567 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2605  type III restriction enzyme, res subunit  23.27 
 
 		 1087 aa  60.5  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0189627  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0843  hypothetical protein  20.53 
 
 		 983 aa  60.5  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.10122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0639  type III restriction enzyme, res subunit  23.89 
 
 		 1009 aa  59.7  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.28859  n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3444  type III restriction protein res subunit  24.49 
 
 		 1012 aa  58.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0939  hypothetical protein  27.16 
 
 		 313 aa  58.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.702425 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2689  hypothetical protein  32.26 
 
 		 1063 aa  57.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.11077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0077  type I restriction-modification system subunit R  25.73 
 
 		 1067 aa  57.4  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2267  type I restriction-modification system endonuclease  23.38 
 
 		 1023 aa  57.4  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0265  type III restriction protein res subunit  20.92 
 
 		 1010 aa  56.6  0.0000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.268157  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2175  hypothetical protein  22.39 
 
 		 1031 aa  56.2  0.0000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.144452  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1363  putative type I restriction enzyme HsdR  24.42 
 
 		 1022 aa  55.8  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6264  type III restriction protein res subunit  25.56 
 
 		 1016 aa  54.7  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.724284  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1787  type III restriction enzyme, res subunit  22.67 
 
 		 1011 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.990163  normal  0.226288 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003238  type I restriction-modification system restriction subunit R  23.64 
 
 		 1023 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0424  type I restriction enzyme, R subunit  24.18 
 
 		 1102 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0274  type I restriction-modification system, R subunit, putative  24.39 
 
 		 1002 aa  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.273589  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1065  DEAD/DEAH box helicase-like  21.91 
 
 		 1039 aa  50.4  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00124695  normal  0.0212089 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1497  protein of unknown function DUF450  25.23 
 
 		 1051 aa  48.5  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0324371  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3575  protein of unknown function DUF450  26.8 
 
 		 976 aa  46.2  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2221  type III restriction enzyme, res subunit  21.55 
 
 		 905 aa  45.8  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.432598  normal  0.944916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>