116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0967 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0967  hypothetical protein  100 
 
 
321 aa  637    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0860  hypothetical protein  77.33 
 
 
322 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5194  putative peptidase PatA-like protein  52.47 
 
 
323 aa  298  1e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0709  hypothetical protein  44.37 
 
 
306 aa  210  2e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  normal  0.120296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2362  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.07 
 
 
666 aa  172  1e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814035  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0506  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  39.86 
 
 
661 aa  159  9e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.66 
 
 
702 aa  95.1  2e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
1012 aa  81.3  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0277  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.02 
 
 
654 aa  72.4  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.72 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.07 
 
 
313 aa  65.9  0.0000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  29.6 
 
 
1315 aa  64.3  0.000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28 
 
 
453 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.78 
 
 
495 aa  62.4  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.91 
 
 
425 aa  62  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.948372  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0259  putative protease  29.62 
 
 
395 aa  60.5  0.00000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.31 
 
 
452 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.97 
 
 
558 aa  56.2  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.51 
 
 
396 aa  56.2  0.0000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.75 
 
 
298 aa  55.8  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.9 
 
 
392 aa  55.5  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2980  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.398884 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 
298 aa  55.5  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.75 
 
 
587 aa  55.1  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.96 
 
 
433 aa  54.7  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
316 aa  55.1  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.22 
 
 
737 aa  55.1  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.02 
 
 
966 aa  53.9  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.96 
 
 
401 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.26 
 
 
605 aa  53.9  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  25.87 
 
 
316 aa  53.5  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
587 aa  53.1  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.73 
 
 
627 aa  53.5  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  25.83 
 
 
339 aa  53.1  0.000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  27.31 
 
 
315 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  25.87 
 
 
316 aa  52.8  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.69 
 
 
627 aa  52.8  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  25.97 
 
 
399 aa  52.8  0.000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.03 
 
 
449 aa  52.4  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8079  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.98 
 
 
386 aa  52.8  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1185  subtilisin-like serine protease-like  29.49 
 
 
891 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  26.15 
 
 
315 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  25.48 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  25.48 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.4 
 
 
487 aa  51.2  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  25.48 
 
 
316 aa  51.6  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  25.48 
 
 
316 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  25.48 
 
 
316 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.48 
 
 
658 aa  50.8  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.45 
 
 
370 aa  50.4  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  24.61 
 
 
644 aa  50.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2246  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
627 aa  50.1  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 
440 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0715  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  32.33 
 
 
541 aa  49.3  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.42 
 
 
639 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3954  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.95 
 
 
396 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8518  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.67 
 
 
400 aa  49.3  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  normal  0.0186801 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.32 
 
 
555 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.1109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.95 
 
 
612 aa  48.1  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2457  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.53 
 
 
678 aa  48.1  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.551982 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.98 
 
 
517 aa  47.8  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00000329781  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.66 
 
 
639 aa  47.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3977  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  25.82 
 
 
377 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.745092 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3756  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.47 
 
 
601 aa  47.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.652103  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3835  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.9 
 
 
441 aa  47  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0420165  normal  0.195306 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.72 
 
 
699 aa  47  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.45 
 
 
431 aa  47  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.13 
 
 
295 aa  46.6  0.0005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1190  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.5 
 
 
544 aa  46.6  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0605  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 
431 aa  46.6  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1681  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.31 
 
 
444 aa  46.2  0.0007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.280538  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.45 
 
 
671 aa  46.2  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8383  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.75 
 
 
463 aa  46.2  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57734  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.58 
 
 
349 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0689  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27 
 
 
464 aa  46.2  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.84 
 
 
1054 aa  46.2  0.0008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  26.36 
 
 
397 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  26.36 
 
 
397 aa  45.8  0.0009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  26.36 
 
 
397 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  26.36 
 
 
397 aa  45.8  0.0009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.54 
 
 
431 aa  45.8  0.0009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  26.36 
 
 
397 aa  45.8  0.0009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3547  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.85 
 
 
556 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0314  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.43 
 
 
1172 aa  45.4  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.498901  normal  0.380582 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.84 
 
 
368 aa  45.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  31.61 
 
 
1106 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.49 
 
 
490 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.35 
 
 
1052 aa  45.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 
597 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.72 
 
 
1060 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.57 
 
 
415 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.78 
 
 
510 aa  44.7  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5989  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.34 
 
 
535 aa  44.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.852027 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0791  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.54 
 
 
835 aa  44.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1456  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.75 
 
 
594 aa  44.3  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.661246  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  25.25 
 
 
577 aa  44.3  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  26.59 
 
 
533 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  21.12 
 
 
297 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.44 
 
 
462 aa  43.9  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.13 
 
 
595 aa  43.9  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>