66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0860 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_0860  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  631  1e-180  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0967  hypothetical protein  77.33 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5194  putative peptidase PatA-like protein  52.63 
 
 		 323 aa  301  8.000000000000001e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0709  hypothetical protein  45.24 
 
 		 306 aa  211  1e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  normal  0.120296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2362  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.63 
 
 		 666 aa  169  5e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0506  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.32 
 
 		 661 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.74 
 
 		 702 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 1012 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0277  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.28 
 
 		 654 aa  64.7  0.000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.63 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.89 
 
 		 452 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0259  putative protease  26.34 
 
 		 395 aa  58.9  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.48 
 
 		 453 aa  58.9  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  27.72 
 
 		 1315 aa  58.5  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  27.97 
 
 		 410 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.76 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.223191  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.33 
 
 		 495 aa  53.5  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 627 aa  53.1  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0200  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.18 
 
 		 658 aa  52  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8518  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.37 
 
 		 400 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.964571  normal  0.0186801 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.63 
 
 		 433 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8079  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.11 
 
 		 386 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0274  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 		 440 aa  51.2  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.13 
 
 		 540 aa  51.2  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1151  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.51 
 
 		 449 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0797814  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 		 605 aa  50.1  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.06 
 
 		 1060 aa  49.3  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.53 
 
 		 396 aa  48.9  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1707  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  22.81 
 
 		 737 aa  48.5  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.29 
 
 		 577 aa  49.3  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2643  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.11 
 
 		 462 aa  48.1  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.85 
 
 		 627 aa  48.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.06 
 
 		 626 aa  48.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0682  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.39 
 
 		 349 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.520693  normal  0.10054 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0507  serine protease  26.05 
 
 		 606 aa  47.4  0.0003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.233077 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0749  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.36 
 
 		 587 aa  47.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  21.76 
 
 		 295 aa  47.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  24.11 
 
 		 339 aa  47  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3342  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 		 966 aa  47  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.12 
 
 		 558 aa  47  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1888  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.35 
 
 		 626 aa  46.6  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.67203  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.51 
 
 		 431 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1437  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.71 
 
 		 425 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.948372  normal  0.0800108 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8383  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  28.33 
 
 		 463 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2980  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  26.41 
 
 		 411 aa  46.2  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.398884 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.59 
 
 		 398 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.96 
 
 		 431 aa  46.2  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1050  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.44 
 
 		 413 aa  45.8  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.141106  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1426  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.61 
 
 		 1241 aa  45.4  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123666  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03458  cold-active serine alkaline protease  29.79 
 
 		 533 aa  45.8  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0416206  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.3 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7018  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.22 
 
 		 447 aa  45.4  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0751  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.91 
 
 		 587 aa  45.4  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.72 
 
 		 487 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5487  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.22 
 
 		 671 aa  44.7  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.153721  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2156  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.39 
 
 		 401 aa  44.7  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2958  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.63 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0274714  normal  0.130085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.02 
 
 		 415 aa  43.9  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3547  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.52 
 
 		 556 aa  43.5  0.005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.777163 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  23.18 
 
 		 298 aa  43.1  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.78 
 
 		 1052 aa  43.1  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.81 
 
 		 370 aa  42.7  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4648  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.52 
 
 		 699 aa  42.7  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.05 
 
 		 639 aa  42.7  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0124345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.3 
 
 		 797 aa  42.7  0.009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  25.81 
 
 		 692 aa  42.4  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>