158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0709 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007925  RPC_0709  hypothetical protein  100 
 
 
306 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  normal  0.120296 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0860  hypothetical protein  45.24 
 
 
322 aa  230  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0967  hypothetical protein  44.37 
 
 
321 aa  209  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2362  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.27 
 
 
666 aa  164  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814035  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5194  putative peptidase PatA-like protein  41.04 
 
 
323 aa  158  9e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0506  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  41.98 
 
 
661 aa  152  8.999999999999999e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 
702 aa  101  1e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 
1012 aa  85.1  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.39 
 
 
313 aa  76.3  0.0000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3756  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.69 
 
 
601 aa  69.7  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.652103  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0277  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.22 
 
 
654 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.52 
 
 
452 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5739  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.19 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.750481  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.66 
 
 
453 aa  64.7  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0471  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.28 
 
 
433 aa  63.5  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0717859 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0040  minor extracellular protease epr  24.7 
 
 
297 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0844257 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  26.75 
 
 
298 aa  62.4  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.55 
 
 
595 aa  61.6  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8079  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.67 
 
 
386 aa  61.6  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2027  aerolysin  28.96 
 
 
399 aa  60.1  0.00000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.34 
 
 
1054 aa  59.3  0.00000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1829  intracellular serine protease  30.43 
 
 
316 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.55 
 
 
487 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.36 
 
 
415 aa  58.2  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3892  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.69 
 
 
295 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000195035  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2035  intracellular serine protease  30.43 
 
 
316 aa  58.2  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2923000000000002e-27 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3306  intracellular serine protease  29.13 
 
 
315 aa  57.4  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00151465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1864  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.41 
 
 
316 aa  57.8  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1859  intracellular serine protease  30 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.749891  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1813  intracellular serine protease  30 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2001  intracellular serine protease  30 
 
 
316 aa  57  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.8 
 
 
558 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2078  intracellular serine protease  30.08 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0118694  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2098  intracellular serine protease  30 
 
 
316 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00047952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2003  intracellular serine protease  28.7 
 
 
315 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  24.23 
 
 
307 aa  55.8  0.0000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5185  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.27 
 
 
605 aa  55.8  0.0000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193898  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0298  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.57 
 
 
320 aa  55.8  0.0000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000146885  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0291  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.57 
 
 
320 aa  55.8  0.0000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0259  putative protease  27.41 
 
 
395 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0089  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.86 
 
 
368 aa  55.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1379  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.78 
 
 
641 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.863708  normal  0.0771449 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2600  subtilisin-like serine protease-like  29.18 
 
 
1315 aa  54.3  0.000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0639979  normal  0.124831 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
710 aa  54.7  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.43 
 
 
797 aa  53.9  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05170  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
653 aa  54.3  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.04 
 
 
540 aa  53.5  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0265  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.61 
 
 
320 aa  53.1  0.000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.95 
 
 
396 aa  53.1  0.000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1052  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
1052 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.865489  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8383  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.89 
 
 
463 aa  52.8  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.57734  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.6 
 
 
627 aa  52.8  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2980  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.54 
 
 
411 aa  52  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.398884 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2836  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.61 
 
 
440 aa  51.6  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2222  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.21 
 
 
891 aa  51.2  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.55 
 
 
431 aa  50.8  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3954  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  36.79 
 
 
396 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000174945 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2345  alkaline serine protease, subtilase family  26.18 
 
 
397 aa  51.2  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2075  subtilisin  26.94 
 
 
485 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.734666  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2980  alkaline serine protease, subtilase family  25.96 
 
 
397 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.503855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3318  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.3 
 
 
401 aa  50.1  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.247832  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1390  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
805 aa  49.7  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000278441  hitchhiker  0.0000000134181 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1086  intracellular serine protease  27.31 
 
 
339 aa  50.1  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
392 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2919  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.58 
 
 
1876 aa  49.7  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.830797  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.88 
 
 
1060 aa  49.7  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5792  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.17 
 
 
1285 aa  49.7  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.193425  normal  0.237593 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.7 
 
 
597 aa  49.3  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0605  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.13 
 
 
431 aa  49.3  0.00008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2143  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  23.48 
 
 
370 aa  49.3  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4101  minor extracellular protease  27.34 
 
 
917 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0393  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 
660 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.13824 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4488  minor extracellular protease VpR  27.34 
 
 
917 aa  49.3  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2657  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.31 
 
 
627 aa  48.9  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.83 
 
 
807 aa  48.9  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000415164  unclonable  0.00000378434 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0480  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.57 
 
 
431 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.255354  normal  0.124332 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1466  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.67 
 
 
1234 aa  48.9  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719877  normal  0.242964 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2480  alkaline serine protease, subtilase family  25.53 
 
 
397 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2410  alkaline serine protease  25.53 
 
 
397 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.329944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2053  serine protease  30.84 
 
 
1570 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.322612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2216  alkaline serine protease  25.65 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00115327  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2155  alkaline serine protease  25.65 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.130046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2139  alkaline serine protease  25.65 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.478532  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2380  alkaline serine protease  25.65 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0299  hypothetical protein  29.08 
 
 
577 aa  48.1  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348055 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  27.97 
 
 
615 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1443  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.71 
 
 
809 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000125277  hitchhiker  0.0000000821824 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.94 
 
 
510 aa  48.1  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0553  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.48 
 
 
440 aa  47.8  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.00000000105969  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1426  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 
1241 aa  47.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.123666  hitchhiker  0.00136869 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2398  alkaline serine protease, subtilase family  25.65 
 
 
397 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8381  Subtilisin-like protein serine protease-like protein  30.82 
 
 
410 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0791  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.94 
 
 
835 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1465  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.56 
 
 
1230 aa  47.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.233669 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.97 
 
 
689 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  27.85 
 
 
513 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3421  subtilisin DY  28.44 
 
 
496 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0938  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.33 
 
 
412 aa  47.4  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.980042 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2370  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.62 
 
 
1124 aa  47.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3106  cold-active serine alkaline protease  28.22 
 
 
807 aa  47  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>