12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5194 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_5194  putative peptidase PatA-like protein  100 
 
 		 323 aa  643    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.261774  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0860  hypothetical protein  52.63 
 
 		 322 aa  313  3.9999999999999997e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0967  hypothetical protein  52.47 
 
 		 321 aa  292  5e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0709  hypothetical protein  41.04 
 
 		 306 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.244861  normal  0.120296 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2362  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  33.21 
 
 		 666 aa  124  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.814035  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0506  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  35.51 
 
 		 661 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.32 
 
 		 702 aa  73.9  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0521  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 		 1012 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.200159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25 
 
 		 453 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0844  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.04 
 
 		 313 aa  47  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3593  subtilisin Carlsberg  22.43 
 
 		 298 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.940861  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  22.75 
 
 		 452 aa  43.9  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>